Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.482e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 TMEM161B-AS1-211ENST00000512724 570 ntTSL 34.44□□□□□ -1.72e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 POLD3-204ENST00000528481 513 ntTSL 23.36□□□□□ -1.872e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.452e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 MTG2-207ENST00000471352 785 ntTSL 515.72■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 78.1
EFTUD2Q15029 MTG2-206ENST00000467101 2814 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 78.1
EFTUD2Q15029 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 78.1
EFTUD2Q15029 MTG2-202ENST00000448254 727 ntTSL 513.37□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 78.1
EFTUD2Q15029 RUVBL2-204ENST00000594338 1853 ntTSL 519.96■□□□□ 0.791e-10■■■■■ 77.1
EFTUD2Q15029 RUVBL2-212ENST00000627972 1065 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.691e-10■■■■■ 77.1
EFTUD2Q15029 RPL8-210ENST00000531767 570 ntTSL 514.83□□□□□ -0.041e-13■■■■■ 76.6
EFTUD2Q15029 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.181e-14■■■■■ 76.1
EFTUD2Q15029 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -01e-14■■■■■ 76.1
EFTUD2Q15029 GABARAP-202ENST00000570856 583 ntTSL 213.46□□□□□ -0.251e-14■■■■■ 76.1
EFTUD2Q15029 AC120057.3-201ENST00000570760 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.491e-14■■■■■ 76.1
EFTUD2Q15029 GABARAP-206ENST00000577035 762 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.551e-14■■■■■ 76.1
EFTUD2Q15029 GABARAP-203ENST00000571129 568 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.571e-14■■■■■ 76.1
EFTUD2Q15029 MLF2-211ENST00000564181 637 ntTSL 58.39□□□□□ -1.071e-14■■■■■ 76.1
EFTUD2Q15029 SAT2-204ENST00000570914 765 ntTSL 27.31□□□□□ -1.241e-14■■■■■ 76.1
EFTUD2Q15029 HRAS-207ENST00000468682 749 ntTSL 317.97■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 75.9
EFTUD2Q15029 HRAS-211ENST00000493230 1114 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.413e-9■■■■■ 75.9
EFTUD2Q15029 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 75.9
EFTUD2Q15029 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 75.9
EFTUD2Q15029 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 75.9
EFTUD2Q15029 ZC3H14-210ENST00000555120 580 ntTSL 45.92□□□□□ -1.464e-13■■■■■ 75.1
EFTUD2Q15029 ATXN2L-207ENST00000561732 643 ntTSL 218.3■□□□□ 0.527e-13■■■■■ 74.6
EFTUD2Q15029 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.541e-10■■■■■ 74.5
EFTUD2Q15029 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.311e-10■■■■■ 74.5
EFTUD2Q15029 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-10■■■■■ 74.5
EFTUD2Q15029 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.391e-10■■■■■ 74.5
EFTUD2Q15029 PDIA6-206ENST00000489662 564 ntTSL 411.98□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 74.5
EFTUD2Q15029 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.691e-10■■■■■ 74.5
EFTUD2Q15029 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.761e-10■■■■■ 74.5
EFTUD2Q15029 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.022e-17■■■■■ 73.8
EFTUD2Q15029 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.122e-17■■■■■ 73.8
EFTUD2Q15029 TMBIM6-225ENST00000552370 882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.142e-17■■■■■ 73.8
EFTUD2Q15029 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.32e-17■■■■■ 73.8
EFTUD2Q15029 TMBIM6-221ENST00000550040 952 ntTSL 25.89□□□□□ -1.472e-17■■■■■ 73.8
EFTUD2Q15029 TMBIM6-207ENST00000547013 428 ntTSL 25.35□□□□□ -1.552e-17■■■■■ 73.8
EFTUD2Q15029 LYPLA1-209ENST00000520896 578 ntTSL 416.97■□□□□ 0.311e-10■■■■■ 73.5
EFTUD2Q15029 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.211e-10■■■■■ 73.5
EFTUD2Q15029 LYPLA1-206ENST00000519891 559 ntTSL 413.8□□□□□ -0.21e-10■■■■■ 73.5
EFTUD2Q15029 GPI-203ENST00000586077 3053 nt11.25□□□□□ -0.614e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 UBA3-206ENST00000464605 431 ntTSL 221.09■□□□□ 0.971e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 ATP5S-207ENST00000554438 2008 ntTSL 216.71■□□□□ 0.271e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 GRWD1-202ENST00000598711 881 ntTSL 315.46■□□□□ 0.071e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 TCOF1-214ENST00000515035 5240 ntTSL 214.15□□□□□ -0.141e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.211e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 UBA3-207ENST00000465108 804 ntTSL 213.51□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 UBA3-209ENST00000466763 622 ntTSL 213.51□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 ATP5S-211ENST00000557421 501 ntTSL 513.23□□□□□ -0.291e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 ACP2-204ENST00000525230 756 ntTSL 213.04□□□□□ -0.321e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 UBA3-203ENST00000415609 2004 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 UBA3-202ENST00000361055 2154 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 UBA3-210ENST00000485424 652 ntTSL 212.35□□□□□ -0.431e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 UBA3-205ENST00000461934 1224 ntTSL 212.35□□□□□ -0.431e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 ATP5S-209ENST00000555939 708 ntTSL 311.67□□□□□ -0.541e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 TCOF1-203ENST00000394269 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.551e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 UBA3-211ENST00000493957 581 ntTSL 311.3□□□□□ -0.61e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.61e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 ACP2-214ENST00000534752 274 ntTSL 59.78□□□□□ -0.841e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 UBA3-208ENST00000465627 1388 ntTSL 28.87□□□□□ -0.991e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.061e-10■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 HNRNPA3-205ENST00000483137 627 ntTSL 27.67□□□□□ -1.185e-19■■■■■ 73.3
EFTUD2Q15029 HYOU1-202ENST00000526656 862 ntTSL 322.63■■□□□ 1.218e-8■■■■■ 73.2
EFTUD2Q15029 HYOU1-203ENST00000527038 629 ntTSL 221.73■■□□□ 1.078e-8■■■■■ 73.2
EFTUD2Q15029 HYOU1-201ENST00000526354 568 ntTSL 219.89■□□□□ 0.778e-8■■■■■ 73.2
EFTUD2Q15029 HYOU1-206ENST00000530467 552 ntTSL 419.02■□□□□ 0.648e-8■■■■■ 73.2
EFTUD2Q15029 HYOU1-213ENST00000533381 694 ntTSL 318.98■□□□□ 0.638e-8■■■■■ 73.2
EFTUD2Q15029 HYOU1-211ENST00000532421 582 ntTSL 218.95■□□□□ 0.628e-8■■■■■ 73.2
EFTUD2Q15029 HYOU1-214ENST00000534233 711 ntTSL 218.72■□□□□ 0.598e-8■■■■■ 73.2
EFTUD2Q15029 HYOU1-205ENST00000529174 549 ntTSL 416.5■□□□□ 0.238e-8■■■■■ 73.2
EFTUD2Q15029 HYOU1-222ENST00000622474 549 ntTSL 215.33■□□□□ 0.048e-8■■■■■ 73.2
EFTUD2Q15029 HYOU1-216ENST00000610597 491 ntTSL 414.65□□□□□ -0.068e-8■■■■■ 73.2
EFTUD2Q15029 HYOU1-210ENST00000531968 550 ntTSL 412.78□□□□□ -0.368e-8■■■■■ 73.2
EFTUD2Q15029 MMAB-207ENST00000541763 1252 ntTSL 322.16■■□□□ 1.145e-14■■■■■ 73.1
EFTUD2Q15029 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.825e-14■■■■■ 73.1
EFTUD2Q15029 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.595e-14■■■■■ 73.1
EFTUD2Q15029 MMAB-205ENST00000537496 1188 ntTSL 216.85■□□□□ 0.295e-14■■■■■ 73.1
EFTUD2Q15029 MMAB-209ENST00000544051 1089 ntTSL 316.82■□□□□ 0.285e-14■■■■■ 73.1
EFTUD2Q15029 NAPRT-206ENST00000462059 722 ntTSL 216.17■□□□□ 0.187e-18■■■■■ 73.1
EFTUD2Q15029 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.065e-14■■■■■ 73.1
EFTUD2Q15029 PRRC2A-205ENST00000464079 451 ntTSL 27.89□□□□□ -1.155e-14■■■■■ 73.1
EFTUD2Q15029 GAPDH-211ENST00000619601 1086 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.761e-11■■■■■ 73
EFTUD2Q15029 RNASEK-C17orf49-202ENST00000547863 1662 ntTSL 223.88■■□□□ 1.418e-10■■■■■ 72.6
EFTUD2Q15029 RNASEK-205ENST00000552176 1485 ntTSL 223.67■■□□□ 1.388e-10■■■■■ 72.6
EFTUD2Q15029 RNASEK-C17orf49-203ENST00000549775 1856 ntTSL 521.42■■□□□ 1.028e-10■■■■■ 72.6
EFTUD2Q15029 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.628e-10■■■■■ 72.6
EFTUD2Q15029 RNASEK-209ENST00000575822 613 ntTSL 318.33■□□□□ 0.528e-10■■■■■ 72.6
EFTUD2Q15029 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.368e-10■■■■■ 72.6
EFTUD2Q15029 RNASEK-201ENST00000546395 952 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.368e-10■■■■■ 72.6
EFTUD2Q15029 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.028e-10■■■■■ 72.6
EFTUD2Q15029 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.268e-10■■■■■ 72.6
EFTUD2Q15029 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.268e-10■■■■■ 72.6
EFTUD2Q15029 RNASEK-208ENST00000570898 425 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.668e-10■■■■■ 72.6
EFTUD2Q15029 HIRIP3-207ENST00000568880 738 ntTSL 222.87■■□□□ 1.252e-8■■■■■ 72.5
EFTUD2Q15029 HIRIP3-206ENST00000566471 607 ntTSL 312.17□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 72.5
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