Protein–RNA interactions for Protein: Q12428

PDH1, Probable 2-methylcitrate dehydratase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDH1Q12428 TSC10YBR265W 963 nt10.12□□□□□ -0.79
PDH1Q12428 RIB3YDR487C 627 nt10.11□□□□□ -0.79
PDH1Q12428 SHH4YLR164W 507 nt10.11□□□□□ -0.79
PDH1Q12428 AGP1YCL025C 1902 nt10.11□□□□□ -0.79
PDH1Q12428 NBP35YGL091C 987 nt10.1□□□□□ -0.79
PDH1Q12428 YGR012WYGR012W 1182 nt10.1□□□□□ -0.79
PDH1Q12428 CAB5YDR196C 726 nt10.09□□□□□ -0.79
PDH1Q12428 FUN14YAL008W 597 nt10.09□□□□□ -0.79
PDH1Q12428 TOM6YOR045W 186 nt10.09□□□□□ -0.79
PDH1Q12428 HIP1YGR191W 1812 nt10.06□□□□□ -0.8
PDH1Q12428 ADH7YCR105W 1086 nt10.06□□□□□ -0.8
PDH1Q12428 PEX2YJL210W 816 nt10.06□□□□□ -0.8
PDH1Q12428 NRT1YOR071C 1797 nt10.06□□□□□ -0.8
PDH1Q12428 CCA1YER168C 1641 nt10.05□□□□□ -0.8
PDH1Q12428 YJL195CYJL195C 702 nt10.05□□□□□ -0.8
PDH1Q12428 PAU15YIR041W 375 nt10.04□□□□□ -0.8
PDH1Q12428 POM34YLR018C 900 nt10.04□□□□□ -0.8
PDH1Q12428 YLR279WYLR279W 390 nt10.02□□□□□ -0.81
PDH1Q12428 YML089CYML089C 369 nt10.02□□□□□ -0.81
PDH1Q12428 SWE1YJL187C 2460 nt9.99□□□□□ -0.81
PDH1Q12428 MET28YIR017C 564 nt9.99□□□□□ -0.81
PDH1Q12428 LSC2YGR244C 1284 nt9.97□□□□□ -0.81
PDH1Q12428 ADH1YOL086C 1047 nt9.97□□□□□ -0.81
PDH1Q12428 PRO1YDR300C 1287 nt9.96□□□□□ -0.82
PDH1Q12428 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.96□□□□□ -0.82
PDH1Q12428 TIF6YPR016C 738 nt9.96□□□□□ -0.82
PDH1Q12428 YPI1YFR003C 468 nt9.93□□□□□ -0.82
PDH1Q12428 DUS1YML080W 1272 nt9.93□□□□□ -0.82
PDH1Q12428 MSB4YOL112W 1479 nt9.92□□□□□ -0.82
PDH1Q12428 AQY2YLL052C 450 nt9.92□□□□□ -0.82
PDH1Q12428 ATG15YCR068W 1563 nt9.92□□□□□ -0.82
PDH1Q12428 STR3YGL184C 1398 nt9.91□□□□□ -0.82
PDH1Q12428 GPN2YOR262W 1044 nt9.91□□□□□ -0.82
PDH1Q12428 FIT3YOR383C 615 nt9.91□□□□□ -0.82
PDH1Q12428 YEL008WYEL008W 381 nt9.89□□□□□ -0.83
PDH1Q12428 CPD1YGR247W 720 nt9.87□□□□□ -0.83
PDH1Q12428 ESS1YJR017C 513 nt9.85□□□□□ -0.83
PDH1Q12428 LOT5YKL183W 921 nt9.85□□□□□ -0.83
PDH1Q12428 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.84□□□□□ -0.83
PDH1Q12428 GND1YHR183W 1470 nt9.84□□□□□ -0.83
PDH1Q12428 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.82□□□□□ -0.84
PDH1Q12428 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.82□□□□□ -0.84
PDH1Q12428 AAC1YMR056C 930 nt9.81□□□□□ -0.84
PDH1Q12428 ARP6YLR085C 1317 nt9.81□□□□□ -0.84
PDH1Q12428 YCL074WYCL074W 927 nt9.8□□□□□ -0.84
PDH1Q12428 UME6YDR207C 2511 nt9.79□□□□□ -0.84
PDH1Q12428 GAP1YKR039W 1809 nt9.77□□□□□ -0.84
PDH1Q12428 APT2YDR441C 546 nt9.75□□□□□ -0.85
PDH1Q12428 BOR1YNL275W 1731 nt9.75□□□□□ -0.85
PDH1Q12428 NAP1YKR048C 1254 nt9.71□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 HSP60YLR259C 1719 nt9.7□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 ALP1YNL270C 1722 nt9.7□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 SEN2YLR105C 1134 nt9.7□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 SMM1YNR015W 1155 nt9.7□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 FUR4YBR021W 1902 nt9.7□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 YAR028WYAR028W 705 nt9.69□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.67□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 RTN2YDL204W 1182 nt9.66□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 DIF1YLR437C 402 nt9.66□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 PUP1YOR157C 786 nt9.66□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 ZTA1YBR046C 1005 nt9.66□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 AKR2YOR034C 2250 nt9.66□□□□□ -0.86
PDH1Q12428 RIB2YOL066C 1776 nt9.65□□□□□ -0.87
PDH1Q12428 PLB1YMR008C 1995 nt9.64□□□□□ -0.87
PDH1Q12428 FCY21YER060W 1587 nt9.63□□□□□ -0.87
PDH1Q12428 MTG2YHR168W 1557 nt9.63□□□□□ -0.87
PDH1Q12428 PGC1YPL206C 966 nt9.58□□□□□ -0.88
PDH1Q12428 HXT12YIL170W 1374 nt9.58□□□□□ -0.88
PDH1Q12428 PAU5YFL020C 369 nt9.57□□□□□ -0.88
PDH1Q12428 YBR232CYBR232C 360 nt9.56□□□□□ -0.88
PDH1Q12428 VRG4YGL225W 1014 nt9.55□□□□□ -0.88
PDH1Q12428 PRY1YJL079C 900 nt9.55□□□□□ -0.88
PDH1Q12428 UTR1YJR049C 1593 nt9.54□□□□□ -0.88
PDH1Q12428 STP3YLR375W 1032 nt9.53□□□□□ -0.88
PDH1Q12428 ALD4YOR374W 1560 nt9.53□□□□□ -0.88
PDH1Q12428 BSP1YPR171W 1731 nt9.52□□□□□ -0.89
PDH1Q12428 PRP4YPR178W 1398 nt9.5□□□□□ -0.89
PDH1Q12428 YJL064WYJL064W 396 nt9.5□□□□□ -0.89
PDH1Q12428 SSN3YPL042C 1668 nt9.49□□□□□ -0.89
PDH1Q12428 UGA4YDL210W 1716 nt9.48□□□□□ -0.89
PDH1Q12428 CCT5YJR064W 1689 nt9.47□□□□□ -0.89
PDH1Q12428 DPS1YLL018C 1674 nt9.46□□□□□ -0.89
PDH1Q12428 YJL055WYJL055W 738 nt9.46□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 PAU19YMR325W 375 nt9.46□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 YKR005CYKR005C 1578 nt9.46□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 SED1YDR077W 1017 nt9.45□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.44□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.44□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 SAM35YHR083W 990 nt9.44□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 TIM44YIL022W 1296 nt9.44□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.44□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.44□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.44□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 YGR259CYGR259C 441 nt9.42□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 ALG12YNR030W 1656 nt9.4□□□□□ -0.9
PDH1Q12428 TAF13YML098W 504 nt9.39□□□□□ -0.91
PDH1Q12428 SLG1YOR008C 1137 nt9.39□□□□□ -0.91
PDH1Q12428 LIP1YMR298W 453 nt9.38□□□□□ -0.91
PDH1Q12428 YJR114WYJR114W 393 nt9.37□□□□□ -0.91
PDH1Q12428 BMT6YLR063W 1098 nt9.37□□□□□ -0.91
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