Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YML089CYML089C 369 nt8.62□□□□□ -1.03
USB1Q12208 SNF1YDR477W 1902 nt8.61□□□□□ -1.03
USB1Q12208 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.6□□□□□ -1.03
USB1Q12208 MRP20YDR405W 792 nt8.59□□□□□ -1.03
USB1Q12208 GAP1YKR039W 1809 nt8.59□□□□□ -1.03
USB1Q12208 SFA1YDL168W 1161 nt8.58□□□□□ -1.04
USB1Q12208 PRO1YDR300C 1287 nt8.58□□□□□ -1.04
USB1Q12208 POM34YLR018C 900 nt8.58□□□□□ -1.04
USB1Q12208 ATG15YCR068W 1563 nt8.57□□□□□ -1.04
USB1Q12208 SHH4YLR164W 507 nt8.57□□□□□ -1.04
USB1Q12208 YGL034CYGL034C 366 nt8.56□□□□□ -1.04
USB1Q12208 SAM35YHR083W 990 nt8.56□□□□□ -1.04
USB1Q12208 BIO5YNR056C 1686 nt8.54□□□□□ -1.04
USB1Q12208 CLB6YGR109C 1143 nt8.53□□□□□ -1.04
USB1Q12208 XYL2YLR070C 1071 nt8.53□□□□□ -1.04
USB1Q12208 TOM6YOR045W 186 nt8.53□□□□□ -1.04
USB1Q12208 SBA1YKL117W 651 nt8.52□□□□□ -1.05
USB1Q12208 COQ2YNR041C 1119 nt8.52□□□□□ -1.05
USB1Q12208 AIM45YPR004C 1035 nt8.51□□□□□ -1.05
USB1Q12208 UTR1YJR049C 1593 nt8.5□□□□□ -1.05
USB1Q12208 RPL4BYDR012W 1089 nt8.49□□□□□ -1.05
USB1Q12208 RPL4AYBR031W 1089 nt8.49□□□□□ -1.05
USB1Q12208 ALD4YOR374W 1560 nt8.48□□□□□ -1.05
USB1Q12208 PRM5YIL117C 957 nt8.47□□□□□ -1.05
USB1Q12208 PEX2YJL210W 816 nt8.47□□□□□ -1.05
USB1Q12208 UTH1YKR042W 1098 nt8.47□□□□□ -1.05
USB1Q12208 HIP1YGR191W 1812 nt8.47□□□□□ -1.05
USB1Q12208 MET28YIR017C 564 nt8.46□□□□□ -1.06
USB1Q12208 NAR1YNL240C 1476 nt8.45□□□□□ -1.06
USB1Q12208 GID7YCL039W 2238 nt8.45□□□□□ -1.06
USB1Q12208 TIF6YPR016C 738 nt8.45□□□□□ -1.06
USB1Q12208 RBG1YAL036C 1110 nt8.44□□□□□ -1.06
USB1Q12208 NRT1YOR071C 1797 nt8.43□□□□□ -1.06
USB1Q12208 DIF1YLR437C 402 nt8.42□□□□□ -1.06
USB1Q12208 BSP1YPR171W 1731 nt8.41□□□□□ -1.06
USB1Q12208 NDI1YML120C 1542 nt8.41□□□□□ -1.06
USB1Q12208 CYT2YKL087C 675 nt8.41□□□□□ -1.06
USB1Q12208 HIF1YLL022C 1158 nt8.4□□□□□ -1.06
USB1Q12208 FIT3YOR383C 615 nt8.4□□□□□ -1.06
USB1Q12208 PBP1YGR178C 2169 nt8.39□□□□□ -1.07
USB1Q12208 RPS14BYJL191W 417 nt8.38□□□□□ -1.07
USB1Q12208 YAR028WYAR028W 705 nt8.38□□□□□ -1.07
USB1Q12208 GLR1YPL091W 1452 nt8.35□□□□□ -1.07
USB1Q12208 YMR244WYMR244W 1068 nt8.34□□□□□ -1.07
USB1Q12208 TSC10YBR265W 963 nt8.33□□□□□ -1.08
USB1Q12208 ALP1YNL270C 1722 nt8.32□□□□□ -1.08
USB1Q12208 ESBP6YNL125C 2022 nt8.32□□□□□ -1.08
USB1Q12208 HXT1YHR094C 1713 nt8.32□□□□□ -1.08
USB1Q12208 ZRT3YKL175W 1512 nt8.31□□□□□ -1.08
USB1Q12208 SED1YDR077W 1017 nt8.31□□□□□ -1.08
USB1Q12208 SDH5YOL071W 489 nt8.31□□□□□ -1.08
USB1Q12208 NPP1YCR026C 2229 nt8.3□□□□□ -1.08
USB1Q12208 LIP1YMR298W 453 nt8.29□□□□□ -1.08
USB1Q12208 DBP1YPL119C 1854 nt8.28□□□□□ -1.08
USB1Q12208 MTG2YHR168W 1557 nt8.28□□□□□ -1.08
USB1Q12208 AKR2YOR034C 2250 nt8.28□□□□□ -1.08
USB1Q12208 HSL7YBR133C 2484 nt8.27□□□□□ -1.09
USB1Q12208 YMR226CYMR226C 804 nt8.26□□□□□ -1.09
USB1Q12208 SFP1YLR403W 2052 nt8.25□□□□□ -1.09
USB1Q12208 YAT1YAR035W 2064 nt8.23□□□□□ -1.09
USB1Q12208 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.23□□□□□ -1.09
USB1Q12208 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.23□□□□□ -1.09
USB1Q12208 YGR012WYGR012W 1182 nt8.23□□□□□ -1.09
USB1Q12208 YLR111WYLR111W 333 nt8.23□□□□□ -1.09
USB1Q12208 RFC1YOR217W 2586 nt8.22□□□□□ -1.09
USB1Q12208 RAD23YEL037C 1197 nt8.22□□□□□ -1.09
USB1Q12208 SAM1YLR180W 1149 nt8.22□□□□□ -1.09
USB1Q12208 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
USB1Q12208 RBG2YGR173W 1107 nt8.21□□□□□ -1.1
USB1Q12208 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
USB1Q12208 YLR279WYLR279W 390 nt8.21□□□□□ -1.1
USB1Q12208 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
USB1Q12208 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
USB1Q12208 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
USB1Q12208 ZTA1YBR046C 1005 nt8.2□□□□□ -1.1
USB1Q12208 YBL086CYBL086C 1401 nt8.2□□□□□ -1.1
USB1Q12208 MET2YNL277W 1461 nt8.19□□□□□ -1.1
USB1Q12208 SHY1YGR112W 1170 nt8.18□□□□□ -1.1
USB1Q12208 INA1YLR413W 2028 nt8.18□□□□□ -1.1
USB1Q12208 TOA2YKL058W 369 nt8.17□□□□□ -1.1
USB1Q12208 LEU9YOR108W 1815 nt8.17□□□□□ -1.1
USB1Q12208 HEL2YDR266C 1920 nt8.16□□□□□ -1.1
USB1Q12208 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.16□□□□□ -1.1
USB1Q12208 BRR1YPR057W 1026 nt8.16□□□□□ -1.1
USB1Q12208 ILV2YMR108W 2064 nt8.15□□□□□ -1.11
USB1Q12208 MSB4YOL112W 1479 nt8.14□□□□□ -1.11
USB1Q12208 URA6YKL024C 615 nt8.14□□□□□ -1.11
USB1Q12208 APT2YDR441C 546 nt8.13□□□□□ -1.11
USB1Q12208 DTR1YBR180W 1719 nt8.12□□□□□ -1.11
USB1Q12208 YJL067WYJL067W 351 nt8.12□□□□□ -1.11
USB1Q12208 CMP2YML057W 1815 nt8.11□□□□□ -1.11
USB1Q12208 RIB3YDR487C 627 nt8.11□□□□□ -1.11
USB1Q12208 YPL251WYPL251W 303 nt8.11□□□□□ -1.11
USB1Q12208 PET8YNL003C 855 nt8.1□□□□□ -1.11
USB1Q12208 MEP3YPR138C 1470 nt8.1□□□□□ -1.11
USB1Q12208 SAM2YDR502C 1155 nt8.09□□□□□ -1.11
USB1Q12208 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.09□□□□□ -1.11
USB1Q12208 OYE3YPL171C 1203 nt8.08□□□□□ -1.12
USB1Q12208 GND2YGR256W 1479 nt8.07□□□□□ -1.12
USB1Q12208 GND1YHR183W 1470 nt8.07□□□□□ -1.12
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