Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC173Q0VFZ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC173Q0VFZ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC173Q0VFZ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC173Q0VFZ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC173Q0VFZ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC173Q0VFZ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC173Q0VFZ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC173Q0VFZ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC173Q0VFZ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC173Q0VFZ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC173Q0VFZ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC173Q0VFZ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC173Q0VFZ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC173Q0VFZ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC173Q0VFZ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC173Q0VFZ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC173Q0VFZ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC173Q0VFZ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC173Q0VFZ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC173Q0VFZ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC173Q0VFZ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC173Q0VFZ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC173Q0VFZ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC173Q0VFZ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC173Q0VFZ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC173Q0VFZ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC173Q0VFZ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC173Q0VFZ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC173Q0VFZ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC173Q0VFZ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC173Q0VFZ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC173Q0VFZ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC173Q0VFZ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC173Q0VFZ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC173Q0VFZ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC173Q0VFZ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC173Q0VFZ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC173Q0VFZ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC173Q0VFZ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC173Q0VFZ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC173Q0VFZ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC173Q0VFZ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC173Q0VFZ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC173Q0VFZ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC173Q0VFZ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC173Q0VFZ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC173Q0VFZ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC173Q0VFZ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC173Q0VFZ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms