Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABPB1Q06547 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABPB1Q06547 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABPB1Q06547 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GABPB1Q06547 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABPB1Q06547 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GABPB1Q06547 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GABPB1Q06547 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GABPB1Q06547 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABPB1Q06547 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABPB1Q06547 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABPB1Q06547 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABPB1Q06547 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GABPB1Q06547 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GABPB1Q06547 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GABPB1Q06547 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GABPB1Q06547 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GABPB1Q06547 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GABPB1Q06547 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GABPB1Q06547 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABPB1Q06547 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GABPB1Q06547 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPB1Q06547 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GABPB1Q06547 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABPB1Q06547 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABPB1Q06547 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABPB1Q06547 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABPB1Q06547 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABPB1Q06547 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABPB1Q06547 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABPB1Q06547 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABPB1Q06547 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GABPB1Q06547 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABPB1Q06547 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GABPB1Q06547 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GABPB1Q06547 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPB1Q06547 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPB1Q06547 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPB1Q06547 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPB1Q06547 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPB1Q06547 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPB1Q06547 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABPB1Q06547 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABPB1Q06547 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPB1Q06547 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GABPB1Q06547 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms