Protein–RNA interactions for Protein: Q05899

YLR297W, Uncharacterized vacuolar protein YLR297W, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR297WQ05899 COQ2YNR041C 1119 nt10.75□□□□□ -0.69
YLR297WQ05899 SNF1YDR477W 1902 nt10.74□□□□□ -0.69
YLR297WQ05899 YCR087WYCR087W 516 nt10.74□□□□□ -0.69
YLR297WQ05899 TOM6YOR045W 186 nt10.74□□□□□ -0.69
YLR297WQ05899 MRP20YDR405W 792 nt10.73□□□□□ -0.69
YLR297WQ05899 UME6YDR207C 2511 nt10.69□□□□□ -0.7
YLR297WQ05899 AIM45YPR004C 1035 nt10.69□□□□□ -0.7
YLR297WQ05899 GAP1YKR039W 1809 nt10.69□□□□□ -0.7
YLR297WQ05899 ATG15YCR068W 1563 nt10.69□□□□□ -0.7
YLR297WQ05899 RBG1YAL036C 1110 nt10.68□□□□□ -0.7
YLR297WQ05899 YML089CYML089C 369 nt10.68□□□□□ -0.7
YLR297WQ05899 ALG12YNR030W 1656 nt10.68□□□□□ -0.7
YLR297WQ05899 PEX2YJL210W 816 nt10.66□□□□□ -0.7
YLR297WQ05899 SBA1YKL117W 651 nt10.63□□□□□ -0.71
YLR297WQ05899 BIO5YNR056C 1686 nt10.63□□□□□ -0.71
YLR297WQ05899 UTR1YJR049C 1593 nt10.62□□□□□ -0.71
YLR297WQ05899 NDI1YML120C 1542 nt10.62□□□□□ -0.71
YLR297WQ05899 HIP1YGR191W 1812 nt10.61□□□□□ -0.71
YLR297WQ05899 TIF6YPR016C 738 nt10.6□□□□□ -0.71
YLR297WQ05899 RPL4BYDR012W 1089 nt10.59□□□□□ -0.71
YLR297WQ05899 PRM5YIL117C 957 nt10.59□□□□□ -0.71
YLR297WQ05899 RPL4AYBR031W 1089 nt10.59□□□□□ -0.71
YLR297WQ05899 CLB6YGR109C 1143 nt10.57□□□□□ -0.72
YLR297WQ05899 UTH1YKR042W 1098 nt10.55□□□□□ -0.72
YLR297WQ05899 RPS14BYJL191W 417 nt10.54□□□□□ -0.72
YLR297WQ05899 NRT1YOR071C 1797 nt10.54□□□□□ -0.72
YLR297WQ05899 MET28YIR017C 564 nt10.53□□□□□ -0.72
YLR297WQ05899 DIF1YLR437C 402 nt10.53□□□□□ -0.72
YLR297WQ05899 SAM35YHR083W 990 nt10.49□□□□□ -0.73
YLR297WQ05899 GLR1YPL091W 1452 nt10.49□□□□□ -0.73
YLR297WQ05899 ALD4YOR374W 1560 nt10.48□□□□□ -0.73
YLR297WQ05899 HIF1YLL022C 1158 nt10.47□□□□□ -0.73
YLR297WQ05899 MCH5YOR306C 1566 nt10.46□□□□□ -0.74
YLR297WQ05899 YAR028WYAR028W 705 nt10.43□□□□□ -0.74
YLR297WQ05899 YMR244WYMR244W 1068 nt10.43□□□□□ -0.74
YLR297WQ05899 SDH5YOL071W 489 nt10.43□□□□□ -0.74
YLR297WQ05899 NAR1YNL240C 1476 nt10.42□□□□□ -0.74
YLR297WQ05899 PBP1YGR178C 2169 nt10.41□□□□□ -0.74
YLR297WQ05899 FIT3YOR383C 615 nt10.4□□□□□ -0.74
YLR297WQ05899 TSC10YBR265W 963 nt10.39□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 MTG2YHR168W 1557 nt10.39□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 ZTA1YBR046C 1005 nt10.37□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.36□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.36□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.36□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.36□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.36□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 AKR2YOR034C 2250 nt10.36□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 YGR012WYGR012W 1182 nt10.35□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 CYT2YKL087C 675 nt10.35□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 ALP1YNL270C 1722 nt10.35□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 YLR279WYLR279W 390 nt10.34□□□□□ -0.75
YLR297WQ05899 DBP1YPL119C 1854 nt10.33□□□□□ -0.76
YLR297WQ05899 HXT1YHR094C 1713 nt10.32□□□□□ -0.76
YLR297WQ05899 SED1YDR077W 1017 nt10.31□□□□□ -0.76
YLR297WQ05899 YLR111WYLR111W 333 nt10.31□□□□□ -0.76
YLR297WQ05899 LIP1YMR298W 453 nt10.3□□□□□ -0.76
YLR297WQ05899 RAD23YEL037C 1197 nt10.29□□□□□ -0.76
YLR297WQ05899 MSB4YOL112W 1479 nt10.29□□□□□ -0.76
YLR297WQ05899 YMR226CYMR226C 804 nt10.27□□□□□ -0.77
YLR297WQ05899 YBL086CYBL086C 1401 nt10.25□□□□□ -0.77
YLR297WQ05899 RBG2YGR173W 1107 nt10.25□□□□□ -0.77
YLR297WQ05899 CAB5YDR196C 726 nt10.24□□□□□ -0.77
YLR297WQ05899 ZRT3YKL175W 1512 nt10.23□□□□□ -0.77
YLR297WQ05899 SHY1YGR112W 1170 nt10.21□□□□□ -0.77
YLR297WQ05899 SAM1YLR180W 1149 nt10.2□□□□□ -0.78
YLR297WQ05899 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.2□□□□□ -0.78
YLR297WQ05899 YPL251WYPL251W 303 nt10.2□□□□□ -0.78
YLR297WQ05899 RIB3YDR487C 627 nt10.19□□□□□ -0.78
YLR297WQ05899 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.18□□□□□ -0.78
YLR297WQ05899 BRR1YPR057W 1026 nt10.18□□□□□ -0.78
YLR297WQ05899 LEU9YOR108W 1815 nt10.18□□□□□ -0.78
YLR297WQ05899 TOA2YKL058W 369 nt10.17□□□□□ -0.78
YLR297WQ05899 YAT1YAR035W 2064 nt10.16□□□□□ -0.78
YLR297WQ05899 UGA4YDL210W 1716 nt10.14□□□□□ -0.79
YLR297WQ05899 MEP3YPR138C 1470 nt10.13□□□□□ -0.79
YLR297WQ05899 YMR103CYMR103C 363 nt10.13□□□□□ -0.79
YLR297WQ05899 YJL067WYJL067W 351 nt10.12□□□□□ -0.79
YLR297WQ05899 RPM1RPM1 483 nt10.12□□□□□ -0.79
YLR297WQ05899 GND2YGR256W 1479 nt10.11□□□□□ -0.79
YLR297WQ05899 FCY21YER060W 1587 nt10.11□□□□□ -0.79
YLR297WQ05899 UFO1YML088W 2007 nt10.11□□□□□ -0.79
YLR297WQ05899 URA6YKL024C 615 nt10.09□□□□□ -0.79
YLR297WQ05899 GND1YHR183W 1470 nt10.08□□□□□ -0.8
YLR297WQ05899 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.07□□□□□ -0.8
YLR297WQ05899 SMM1YNR015W 1155 nt10.07□□□□□ -0.8
YLR297WQ05899 APT2YDR441C 546 nt10.06□□□□□ -0.8
YLR297WQ05899 LOT5YKL183W 921 nt10.05□□□□□ -0.8
YLR297WQ05899 OYE3YPL171C 1203 nt10.05□□□□□ -0.8
YLR297WQ05899 INA1YLR413W 2028 nt10.03□□□□□ -0.8
YLR297WQ05899 PRY1YJL079C 900 nt10.02□□□□□ -0.81
YLR297WQ05899 PET8YNL003C 855 nt10.01□□□□□ -0.81
YLR297WQ05899 SSN3YPL042C 1668 nt9.99□□□□□ -0.81
YLR297WQ05899 RPC82YPR190C 1965 nt9.99□□□□□ -0.81
YLR297WQ05899 SAM2YDR502C 1155 nt9.99□□□□□ -0.81
YLR297WQ05899 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.97□□□□□ -0.81
YLR297WQ05899 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.97□□□□□ -0.81
YLR297WQ05899 BNI5YNL166C 1347 nt9.96□□□□□ -0.82
YLR297WQ05899 CSM1YCR086W 573 nt9.95□□□□□ -0.82
YLR297WQ05899 SEC61YLR378C 1443 nt9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.4 ms