Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 MSF1YPR047W 1410 nt8.06□□□□□ -1.12
YHP1Q04116 YDR010CYDR010C 333 nt8.04□□□□□ -1.12
YHP1Q04116 GAP1YKR039W 1809 nt8.03□□□□□ -1.12
YHP1Q04116 PRO1YDR300C 1287 nt8.02□□□□□ -1.13
YHP1Q04116 SHB17YKR043C 816 nt8.01□□□□□ -1.13
YHP1Q04116 POM34YLR018C 900 nt8.01□□□□□ -1.13
YHP1Q04116 CMP2YML057W 1815 nt8□□□□□ -1.13
YHP1Q04116 UBA4YHR111W 1323 nt8□□□□□ -1.13
YHP1Q04116 NDI1YML120C 1542 nt7.99□□□□□ -1.13
YHP1Q04116 SFA1YDL168W 1161 nt7.99□□□□□ -1.13
YHP1Q04116 YSR3YKR053C 1215 nt7.97□□□□□ -1.13
YHP1Q04116 RDN25-1RDN25-1 3396 nt7.96□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 RDN25-2RDN25-2 3396 nt7.96□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.95□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 YML089CYML089C 369 nt7.95□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 ATG15YCR068W 1563 nt7.95□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 HSL7YBR133C 2484 nt7.95□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 RET2YFR051C 1641 nt7.95□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 RPC82YPR190C 1965 nt7.94□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 SAM35YHR083W 990 nt7.94□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 SBA1YKL117W 651 nt7.94□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 YGL034CYGL034C 366 nt7.93□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 DIF1YLR437C 402 nt7.93□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 RPM1RPM1 483 nt7.93□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 TOM6YOR045W 186 nt7.92□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 PHO89YBR296C 1725 nt7.92□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 SPT20YOL148C 1815 nt7.91□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 YCR087WYCR087W 516 nt7.9□□□□□ -1.14
YHP1Q04116 INA1YLR413W 2028 nt7.9□□□□□ -1.15
YHP1Q04116 ZRT3YKL175W 1512 nt7.89□□□□□ -1.15
YHP1Q04116 DBP1YPL119C 1854 nt7.89□□□□□ -1.15
YHP1Q04116 XYL2YLR070C 1071 nt7.88□□□□□ -1.15
YHP1Q04116 TIF6YPR016C 738 nt7.88□□□□□ -1.15
YHP1Q04116 HIP1YGR191W 1812 nt7.85□□□□□ -1.15
YHP1Q04116 MRP20YDR405W 792 nt7.85□□□□□ -1.15
YHP1Q04116 YJL067WYJL067W 351 nt7.84□□□□□ -1.15
YHP1Q04116 PEX2YJL210W 816 nt7.84□□□□□ -1.15
YHP1Q04116 RBG1YAL036C 1110 nt7.83□□□□□ -1.16
YHP1Q04116 COQ2YNR041C 1119 nt7.83□□□□□ -1.16
YHP1Q04116 AIM45YPR004C 1035 nt7.83□□□□□ -1.16
YHP1Q04116 HXT1YHR094C 1713 nt7.83□□□□□ -1.16
YHP1Q04116 SHY1YGR112W 1170 nt7.8□□□□□ -1.16
YHP1Q04116 YAR028WYAR028W 705 nt7.8□□□□□ -1.16
YHP1Q04116 YBL086CYBL086C 1401 nt7.79□□□□□ -1.16
YHP1Q04116 GLR1YPL091W 1452 nt7.79□□□□□ -1.16
YHP1Q04116 MET28YIR017C 564 nt7.77□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 SED1YDR077W 1017 nt7.76□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 MTG2YHR168W 1557 nt7.76□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.75□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.75□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.75□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 YMR244WYMR244W 1068 nt7.75□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 LIP1YMR298W 453 nt7.75□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.75□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.75□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 RPL4BYDR012W 1089 nt7.74□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 CLB6YGR109C 1143 nt7.74□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 RPL4AYBR031W 1089 nt7.74□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 UFO1YML088W 2007 nt7.73□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 UTH1YKR042W 1098 nt7.72□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 ZTA1YBR046C 1005 nt7.72□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 NRT1YOR071C 1797 nt7.71□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 LEU9YOR108W 1815 nt7.71□□□□□ -1.17
YHP1Q04116 YPL251WYPL251W 303 nt7.71□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 RPS14BYJL191W 417 nt7.7□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 AKR2YOR034C 2250 nt7.69□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 ILV3YJR016C 1758 nt7.69□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 HOL1YNR055C 1761 nt7.69□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 URA6YKL024C 615 nt7.69□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 FIT3YOR383C 615 nt7.68□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 ALP1YNL270C 1722 nt7.67□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 MUP1YGR055W 1725 nt7.66□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 SDH5YOL071W 489 nt7.66□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 YOR325WYOR325W 474 nt7.66□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 SAM1YLR180W 1149 nt7.65□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 BRR1YPR057W 1026 nt7.65□□□□□ -1.18
YHP1Q04116 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt7.64□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 YMR226CYMR226C 804 nt7.64□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 RBG2YGR173W 1107 nt7.63□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 YLR111WYLR111W 333 nt7.63□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 TOA2YKL058W 369 nt7.62□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 OYE3YPL171C 1203 nt7.62□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 YNL024CYNL024C 741 nt7.61□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 OPI10YOL032W 741 nt7.61□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 TSC10YBR265W 963 nt7.61□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.6□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 YGL114WYGL114W 2178 nt7.6□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 CWC15YDR163W 528 nt7.59□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 PET8YNL003C 855 nt7.59□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 GND2YGR256W 1479 nt7.59□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 RIM8YGL045W 1629 nt7.59□□□□□ -1.19
YHP1Q04116 RAD23YEL037C 1197 nt7.57□□□□□ -1.2
YHP1Q04116 YLR279WYLR279W 390 nt7.57□□□□□ -1.2
YHP1Q04116 MEP3YPR138C 1470 nt7.56□□□□□ -1.2
YHP1Q04116 CCT2YIL142W 1584 nt7.56□□□□□ -1.2
YHP1Q04116 ACH1YBL015W 1581 nt7.56□□□□□ -1.2
YHP1Q04116 YMR103CYMR103C 363 nt7.56□□□□□ -1.2
YHP1Q04116 YGR012WYGR012W 1182 nt7.55□□□□□ -1.2
YHP1Q04116 FMS1YMR020W 1527 nt7.55□□□□□ -1.2
YHP1Q04116 UGA4YDL210W 1716 nt7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms