Protein–RNA interactions for Protein: Q02209

YKR011C, Uncharacterized protein YKR011C, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR011CQ02209 THI74YDR438W 1113 nt9.15□□□□□ -0.94
YKR011CQ02209 UBA4YHR111W 1323 nt9.14□□□□□ -0.95
YKR011CQ02209 CYT2YKL087C 675 nt9.14□□□□□ -0.95
YKR011CQ02209 POM34YLR018C 900 nt9.13□□□□□ -0.95
YKR011CQ02209 GAP1YKR039W 1809 nt9.12□□□□□ -0.95
YKR011CQ02209 SFA1YDL168W 1161 nt9.12□□□□□ -0.95
YKR011CQ02209 PRO1YDR300C 1287 nt9.12□□□□□ -0.95
YKR011CQ02209 YJR154WYJR154W 1041 nt9.12□□□□□ -0.95
YKR011CQ02209 YML089CYML089C 369 nt9.11□□□□□ -0.95
YKR011CQ02209 NAT4YMR069W 858 nt9.11□□□□□ -0.95
YKR011CQ02209 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.1□□□□□ -0.95
YKR011CQ02209 PHO89YBR296C 1725 nt9.09□□□□□ -0.95
YKR011CQ02209 UTR1YJR049C 1593 nt9.08□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 MSF1YPR047W 1410 nt9.08□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 YSR3YKR053C 1215 nt9.08□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 PAU21YOR394W 495 nt9.08□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 PAU22YPL282C 495 nt9.08□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 Q0010Q0010 387 nt9.08□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 ATG15YCR068W 1563 nt9.07□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 HSL7YBR133C 2484 nt9.07□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 PRM5YIL117C 957 nt9.07□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 YCR087WYCR087W 516 nt9.05□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 TOM6YOR045W 186 nt9.05□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 ALD4YOR374W 1560 nt9.04□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 SAM35YHR083W 990 nt9.04□□□□□ -0.96
YKR011CQ02209 HIF1YLL022C 1158 nt9.02□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 COQ2YNR041C 1119 nt9.01□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 MRP20YDR405W 792 nt9□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 CMP2YML057W 1815 nt9□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.99□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 YGL034CYGL034C 366 nt8.99□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 RPM1RPM1 483 nt8.99□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 ARO7YPR060C 771 nt8.99□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 XYL2YLR070C 1071 nt8.98□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 DIF1YLR437C 402 nt8.98□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 TIF6YPR016C 738 nt8.98□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 HIP1YGR191W 1812 nt8.98□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 PEX2YJL210W 816 nt8.97□□□□□ -0.97
YKR011CQ02209 YAT1YAR035W 2064 nt8.95□□□□□ -0.98
YKR011CQ02209 AIM45YPR004C 1035 nt8.95□□□□□ -0.98
YKR011CQ02209 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.93□□□□□ -0.98
YKR011CQ02209 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.93□□□□□ -0.98
YKR011CQ02209 RPL4BYDR012W 1089 nt8.92□□□□□ -0.98
YKR011CQ02209 MET28YIR017C 564 nt8.92□□□□□ -0.98
YKR011CQ02209 RPL4AYBR031W 1089 nt8.92□□□□□ -0.98
YKR011CQ02209 UTH1YKR042W 1098 nt8.9□□□□□ -0.98
YKR011CQ02209 NRT1YOR071C 1797 nt8.89□□□□□ -0.99
YKR011CQ02209 DBP1YPL119C 1854 nt8.88□□□□□ -0.99
YKR011CQ02209 YAR028WYAR028W 705 nt8.88□□□□□ -0.99
YKR011CQ02209 ZRT3YKL175W 1512 nt8.86□□□□□ -0.99
YKR011CQ02209 RPS14BYJL191W 417 nt8.86□□□□□ -0.99
YKR011CQ02209 RBG1YAL036C 1110 nt8.85□□□□□ -0.99
YKR011CQ02209 HXT1YHR094C 1713 nt8.85□□□□□ -0.99
YKR011CQ02209 NDI1YML120C 1542 nt8.85□□□□□ -0.99
YKR011CQ02209 FIT3YOR383C 615 nt8.84□□□□□ -0.99
YKR011CQ02209 MTG2YHR168W 1557 nt8.82□□□□□ -1
YKR011CQ02209 PAB1YER165W 1734 nt8.82□□□□□ -1
YKR011CQ02209 SED1YDR077W 1017 nt8.81□□□□□ -1
YKR011CQ02209 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.81□□□□□ -1
YKR011CQ02209 LIP1YMR298W 453 nt8.8□□□□□ -1
YKR011CQ02209 ALP1YNL270C 1722 nt8.8□□□□□ -1
YKR011CQ02209 INA1YLR413W 2028 nt8.77□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.77□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.77□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.77□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.77□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.77□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 YBL086CYBL086C 1401 nt8.77□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 AKR2YOR034C 2250 nt8.77□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 SHY1YGR112W 1170 nt8.76□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 ZTA1YBR046C 1005 nt8.75□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 TSC10YBR265W 963 nt8.75□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 SPT20YOL148C 1815 nt8.73□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 YJL067WYJL067W 351 nt8.73□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 RPC82YPR190C 1965 nt8.73□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 LEU9YOR108W 1815 nt8.72□□□□□ -1.01
YKR011CQ02209 SAM1YLR180W 1149 nt8.71□□□□□ -1.02
YKR011CQ02209 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.7□□□□□ -1.02
YKR011CQ02209 YLR279WYLR279W 390 nt8.69□□□□□ -1.02
YKR011CQ02209 SDH5YOL071W 489 nt8.69□□□□□ -1.02
YKR011CQ02209 HEL2YDR266C 1920 nt8.69□□□□□ -1.02
YKR011CQ02209 URA6YKL024C 615 nt8.68□□□□□ -1.02
YKR011CQ02209 YPL251WYPL251W 303 nt8.68□□□□□ -1.02
YKR011CQ02209 YGR012WYGR012W 1182 nt8.67□□□□□ -1.02
YKR011CQ02209 UFO1YML088W 2007 nt8.67□□□□□ -1.02
YKR011CQ02209 BRR1YPR057W 1026 nt8.67□□□□□ -1.02
YKR011CQ02209 TOA2YKL058W 369 nt8.66□□□□□ -1.02
YKR011CQ02209 SBA1YKL117W 651 nt8.65□□□□□ -1.02
YKR011CQ02209 GLR1YPL091W 1452 nt8.64□□□□□ -1.03
YKR011CQ02209 MSB4YOL112W 1479 nt8.64□□□□□ -1.03
YKR011CQ02209 RAD23YEL037C 1197 nt8.62□□□□□ -1.03
YKR011CQ02209 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.61□□□□□ -1.03
YKR011CQ02209 MEP3YPR138C 1470 nt8.6□□□□□ -1.03
YKR011CQ02209 OYE3YPL171C 1203 nt8.6□□□□□ -1.03
YKR011CQ02209 GND2YGR256W 1479 nt8.59□□□□□ -1.03
YKR011CQ02209 YMR103CYMR103C 363 nt8.59□□□□□ -1.03
YKR011CQ02209 PET8YNL003C 855 nt8.59□□□□□ -1.03
YKR011CQ02209 REG2YBR050C 1017 nt8.59□□□□□ -1.03
YKR011CQ02209 YLR111WYLR111W 333 nt8.57□□□□□ -1.04
YKR011CQ02209 APT2YDR441C 546 nt8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7 ms