Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 GAP1YKR039W 1809 nt9.15□□□□□ -0.95
NUP49Q02199 TIR3YIL011W 810 nt9.14□□□□□ -0.95
NUP49Q02199 SAM35YHR083W 990 nt9.12□□□□□ -0.95
NUP49Q02199 SHH4YLR164W 507 nt9.09□□□□□ -0.95
NUP49Q02199 PRO1YDR300C 1287 nt9.07□□□□□ -0.96
NUP49Q02199 RRT5YFR032C 870 nt9.07□□□□□ -0.96
NUP49Q02199 UBX6YJL048C 1191 nt9.06□□□□□ -0.96
NUP49Q02199 YJL067WYJL067W 351 nt9.06□□□□□ -0.96
NUP49Q02199 HEL2YDR266C 1920 nt9.05□□□□□ -0.96
NUP49Q02199 POM34YLR018C 900 nt9.04□□□□□ -0.96
NUP49Q02199 MUP1YGR055W 1725 nt9.03□□□□□ -0.96
NUP49Q02199 RIM8YGL045W 1629 nt9.03□□□□□ -0.96
NUP49Q02199 PAU16YKL224C 372 nt9.03□□□□□ -0.96
NUP49Q02199 YGL114WYGL114W 2178 nt9.01□□□□□ -0.97
NUP49Q02199 DBP1YPL119C 1854 nt9.01□□□□□ -0.97
NUP49Q02199 HOL1YNR055C 1761 nt9.01□□□□□ -0.97
NUP49Q02199 ATG15YCR068W 1563 nt9□□□□□ -0.97
NUP49Q02199 PAU7YAR020C 168 nt9□□□□□ -0.97
NUP49Q02199 MIR1YJR077C 936 nt8.99□□□□□ -0.97
NUP49Q02199 DIF1YLR437C 402 nt8.99□□□□□ -0.97
NUP49Q02199 HXT1YHR094C 1713 nt8.98□□□□□ -0.97
NUP49Q02199 YML089CYML089C 369 nt8.98□□□□□ -0.97
NUP49Q02199 YDR010CYDR010C 333 nt8.96□□□□□ -0.98
NUP49Q02199 SHB17YKR043C 816 nt8.96□□□□□ -0.98
NUP49Q02199 ILV3YJR016C 1758 nt8.94□□□□□ -0.98
NUP49Q02199 SHY1YGR112W 1170 nt8.94□□□□□ -0.98
NUP49Q02199 SFA1YDL168W 1161 nt8.92□□□□□ -0.98
NUP49Q02199 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.9□□□□□ -0.98
NUP49Q02199 YNL024CYNL024C 741 nt8.9□□□□□ -0.98
NUP49Q02199 TOM6YOR045W 186 nt8.9□□□□□ -0.98
NUP49Q02199 RET2YFR051C 1641 nt8.9□□□□□ -0.99
NUP49Q02199 UBA4YHR111W 1323 nt8.89□□□□□ -0.99
NUP49Q02199 THI74YDR438W 1113 nt8.89□□□□□ -0.99
NUP49Q02199 YOR325WYOR325W 474 nt8.89□□□□□ -0.99
NUP49Q02199 YBL086CYBL086C 1401 nt8.88□□□□□ -0.99
NUP49Q02199 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.87□□□□□ -0.99
NUP49Q02199 NAT4YMR069W 858 nt8.85□□□□□ -0.99
NUP49Q02199 TIF6YPR016C 738 nt8.85□□□□□ -0.99
NUP49Q02199 LIP1YMR298W 453 nt8.84□□□□□ -0.99
NUP49Q02199 MSF1YPR047W 1410 nt8.83□□□□□ -1
NUP49Q02199 URA6YKL024C 615 nt8.83□□□□□ -1
NUP49Q02199 PHO89YBR296C 1725 nt8.83□□□□□ -1
NUP49Q02199 SED1YDR077W 1017 nt8.82□□□□□ -1
NUP49Q02199 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.82□□□□□ -1
NUP49Q02199 YAR028WYAR028W 705 nt8.82□□□□□ -1
NUP49Q02199 OPI10YOL032W 741 nt8.82□□□□□ -1
NUP49Q02199 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.81□□□□□ -1
NUP49Q02199 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.81□□□□□ -1
NUP49Q02199 YSR3YKR053C 1215 nt8.81□□□□□ -1
NUP49Q02199 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.81□□□□□ -1
NUP49Q02199 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.81□□□□□ -1
NUP49Q02199 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.81□□□□□ -1
NUP49Q02199 COQ8YGL119W 1506 nt8.8□□□□□ -1
NUP49Q02199 MAE1YKL029C 2010 nt8.8□□□□□ -1
NUP49Q02199 UFO1YML088W 2007 nt8.8□□□□□ -1
NUP49Q02199 PEX2YJL210W 816 nt8.8□□□□□ -1
NUP49Q02199 CWC15YDR163W 528 nt8.79□□□□□ -1
NUP49Q02199 MRP20YDR405W 792 nt8.79□□□□□ -1
NUP49Q02199 HIP1YGR191W 1812 nt8.79□□□□□ -1
NUP49Q02199 FRE6YLL051C 2139 nt8.78□□□□□ -1
NUP49Q02199 LEU9YOR108W 1815 nt8.77□□□□□ -1
NUP49Q02199 UGP1YKL035W 1500 nt8.77□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 HIS2YFR025C 1008 nt8.77□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 CCT2YIL142W 1584 nt8.77□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 ARO8YGL202W 1503 nt8.76□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 YCR087WYCR087W 516 nt8.76□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 MTG2YHR168W 1557 nt8.76□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 YGL034CYGL034C 366 nt8.75□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 COQ2YNR041C 1119 nt8.75□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 SAM1YLR180W 1149 nt8.74□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 MET28YIR017C 564 nt8.73□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 XYL2YLR070C 1071 nt8.73□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 YMR209CYMR209C 1374 nt8.73□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 OYE3YPL171C 1203 nt8.72□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 YPL251WYPL251W 303 nt8.72□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 KES1YPL145C 1305 nt8.72□□□□□ -1.01
NUP49Q02199 BRR1YPR057W 1026 nt8.71□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 SGA1YIL099W 1650 nt8.71□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 LSB6YJL100W 1824 nt8.7□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 TOA2YKL058W 369 nt8.7□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 PET8YNL003C 855 nt8.7□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 AIM45YPR004C 1035 nt8.7□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 AKR2YOR034C 2250 nt8.68□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 ACO2YJL200C 2370 nt8.68□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 ZTA1YBR046C 1005 nt8.68□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 BET2YPR176C 978 nt8.68□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 ALP1YNL270C 1722 nt8.66□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.66□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 ACH1YBL015W 1581 nt8.65□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 GND2YGR256W 1479 nt8.65□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 ZAP1YJL056C 2643 nt8.65□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 RPL4BYDR012W 1089 nt8.65□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 RPL4AYBR031W 1089 nt8.65□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 NRT1YOR071C 1797 nt8.65□□□□□ -1.02
NUP49Q02199 FMS1YMR020W 1527 nt8.64□□□□□ -1.03
NUP49Q02199 UTH1YKR042W 1098 nt8.63□□□□□ -1.03
NUP49Q02199 SPP2YOR148C 558 nt8.63□□□□□ -1.03
NUP49Q02199 MET2YNL277W 1461 nt8.63□□□□□ -1.03
NUP49Q02199 CLB6YGR109C 1143 nt8.62□□□□□ -1.03
NUP49Q02199 FIT3YOR383C 615 nt8.62□□□□□ -1.03
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