Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms