Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh3bp1P55194 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3bp1P55194 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sh3bp1P55194 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3bp1P55194 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bp1P55194 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bp1P55194 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bp1P55194 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bp1P55194 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bp1P55194 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sh3bp1P55194 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh3bp1P55194 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh3bp1P55194 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bp1P55194 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bp1P55194 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3bp1P55194 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3bp1P55194 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3bp1P55194 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3bp1P55194 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3bp1P55194 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sh3bp1P55194 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sh3bp1P55194 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bp1P55194 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp1P55194 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3bp1P55194 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp1P55194 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp1P55194 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp1P55194 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3bp1P55194 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3bp1P55194 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sh3bp1P55194 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sh3bp1P55194 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp1P55194 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp1P55194 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp1P55194 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp1P55194 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp1P55194 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3bp1P55194 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp1P55194 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp1P55194 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp1P55194 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh3bp1P55194 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh3bp1P55194 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh3bp1P55194 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp1P55194 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp1P55194 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp1P55194 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp1P55194 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3bp1P55194 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3bp1P55194 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp1P55194 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp1P55194 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp1P55194 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3bp1P55194 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Sh3bp1P55194 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp1P55194 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp1P55194 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp1P55194 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp1P55194 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp1P55194 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp1P55194 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp1P55194 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp1P55194 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sh3bp1P55194 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp1P55194 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp1P55194 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3bp1P55194 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3bp1P55194 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp1P55194 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp1P55194 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp1P55194 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp1P55194 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp1P55194 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp1P55194 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sh3bp1P55194 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp1P55194 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp1P55194 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp1P55194 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp1P55194 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp1P55194 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp1P55194 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp1P55194 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp1P55194 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp1P55194 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp1P55194 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms