Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GYS2P54840 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GYS2P54840 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GYS2P54840 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GYS2P54840 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GYS2P54840 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GYS2P54840 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GYS2P54840 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GYS2P54840 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GYS2P54840 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GYS2P54840 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GYS2P54840 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GYS2P54840 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GYS2P54840 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GYS2P54840 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GYS2P54840 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GYS2P54840 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GYS2P54840 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
GYS2P54840 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GYS2P54840 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GYS2P54840 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GYS2P54840 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GYS2P54840 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GYS2P54840 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GYS2P54840 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GYS2P54840 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GYS2P54840 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GYS2P54840 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GYS2P54840 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GYS2P54840 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GYS2P54840 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GYS2P54840 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GYS2P54840 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GYS2P54840 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GYS2P54840 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GYS2P54840 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GYS2P54840 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GYS2P54840 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GYS2P54840 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GYS2P54840 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GYS2P54840 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GYS2P54840 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GYS2P54840 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GYS2P54840 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GYS2P54840 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GYS2P54840 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GYS2P54840 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GYS2P54840 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GYS2P54840 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GYS2P54840 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GYS2P54840 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GYS2P54840 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GYS2P54840 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GYS2P54840 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GYS2P54840 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GYS2P54840 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GYS2P54840 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GYS2P54840 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GYS2P54840 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GYS2P54840 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GYS2P54840 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GYS2P54840 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GYS2P54840 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GYS2P54840 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GYS2P54840 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GYS2P54840 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GYS2P54840 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GYS2P54840 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GYS2P54840 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GYS2P54840 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GYS2P54840 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GYS2P54840 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GYS2P54840 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GYS2P54840 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GYS2P54840 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GYS2P54840 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GYS2P54840 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GYS2P54840 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GYS2P54840 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GYS2P54840 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GYS2P54840 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GYS2P54840 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GYS2P54840 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GYS2P54840 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GYS2P54840 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GYS2P54840 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GYS2P54840 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GYS2P54840 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GYS2P54840 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GYS2P54840 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GYS2P54840 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GYS2P54840 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GYS2P54840 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GYS2P54840 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GYS2P54840 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GYS2P54840 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GYS2P54840 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GYS2P54840 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GYS2P54840 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GYS2P54840 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms