Protein–RNA interactions for Protein: P48723

HSPA13, Heat shock 70 kDa protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA13P48723 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HSPA13P48723 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSPA13P48723 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HSPA13P48723 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HSPA13P48723 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSPA13P48723 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSPA13P48723 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSPA13P48723 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSPA13P48723 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSPA13P48723 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA13P48723 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA13P48723 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA13P48723 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA13P48723 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA13P48723 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA13P48723 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA13P48723 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA13P48723 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HSPA13P48723 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA13P48723 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA13P48723 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA13P48723 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA13P48723 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA13P48723 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA13P48723 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA13P48723 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA13P48723 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA13P48723 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA13P48723 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA13P48723 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA13P48723 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA13P48723 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA13P48723 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSPA13P48723 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSPA13P48723 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSPA13P48723 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA13P48723 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPA13P48723 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPA13P48723 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPA13P48723 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPA13P48723 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms