Protein–RNA interactions for Protein: P47108

URB2, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
URB2P47108 INA1YLR413W 2028 nt10.17□□□□□ -0.78
URB2P47108 YDR010CYDR010C 333 nt10.17□□□□□ -0.78
URB2P47108 PAU7YAR020C 168 nt10.16□□□□□ -0.78
URB2P47108 ATG15YCR068W 1563 nt10.14□□□□□ -0.79
URB2P47108 SFA1YDL168W 1161 nt10.14□□□□□ -0.79
URB2P47108 SAM35YHR083W 990 nt10.14□□□□□ -0.79
URB2P47108 SHB17YKR043C 816 nt10.13□□□□□ -0.79
URB2P47108 ZRT3YKL175W 1512 nt10.12□□□□□ -0.79
URB2P47108 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.11□□□□□ -0.79
URB2P47108 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.11□□□□□ -0.79
URB2P47108 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.11□□□□□ -0.79
URB2P47108 TOM6YOR045W 186 nt10.1□□□□□ -0.79
URB2P47108 DIF1YLR437C 402 nt10.09□□□□□ -0.79
URB2P47108 YML089CYML089C 369 nt10.08□□□□□ -0.8
URB2P47108 DBP1YPL119C 1854 nt10.06□□□□□ -0.8
URB2P47108 RET2YFR051C 1641 nt10.05□□□□□ -0.8
URB2P47108 YJL067WYJL067W 351 nt10.05□□□□□ -0.8
URB2P47108 MIR1YJR077C 936 nt10.05□□□□□ -0.8
URB2P47108 HXT1YHR094C 1713 nt10.02□□□□□ -0.8
URB2P47108 PEX2YJL210W 816 nt10□□□□□ -0.81
URB2P47108 TIF6YPR016C 738 nt10□□□□□ -0.81
URB2P47108 PHO89YBR296C 1725 nt9.99□□□□□ -0.81
URB2P47108 UBA4YHR111W 1323 nt9.99□□□□□ -0.81
URB2P47108 SHY1YGR112W 1170 nt9.98□□□□□ -0.81
URB2P47108 RRT5YFR032C 870 nt9.97□□□□□ -0.81
URB2P47108 YDR094WYDR094W 336 nt9.96□□□□□ -0.82
URB2P47108 HIP1YGR191W 1812 nt9.96□□□□□ -0.82
URB2P47108 YBL086CYBL086C 1401 nt9.94□□□□□ -0.82
URB2P47108 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.94□□□□□ -0.82
URB2P47108 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.94□□□□□ -0.82
URB2P47108 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.94□□□□□ -0.82
URB2P47108 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.94□□□□□ -0.82
URB2P47108 COQ2YNR041C 1119 nt9.94□□□□□ -0.82
URB2P47108 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.94□□□□□ -0.82
URB2P47108 PAU16YKL224C 372 nt9.93□□□□□ -0.82
URB2P47108 HEL2YDR266C 1920 nt9.93□□□□□ -0.82
URB2P47108 MUP1YGR055W 1725 nt9.92□□□□□ -0.82
URB2P47108 YAR028WYAR028W 705 nt9.91□□□□□ -0.82
URB2P47108 LIP1YMR298W 453 nt9.91□□□□□ -0.82
URB2P47108 THI74YDR438W 1113 nt9.9□□□□□ -0.82
URB2P47108 YSR3YKR053C 1215 nt9.9□□□□□ -0.82
URB2P47108 HOL1YNR055C 1761 nt9.9□□□□□ -0.82
URB2P47108 MTG2YHR168W 1557 nt9.88□□□□□ -0.83
URB2P47108 SED1YDR077W 1017 nt9.88□□□□□ -0.83
URB2P47108 YOR325WYOR325W 474 nt9.87□□□□□ -0.83
URB2P47108 RIM8YGL045W 1629 nt9.86□□□□□ -0.83
URB2P47108 MET28YIR017C 564 nt9.86□□□□□ -0.83
URB2P47108 UFO1YML088W 2007 nt9.84□□□□□ -0.83
URB2P47108 ILV3YJR016C 1758 nt9.84□□□□□ -0.83
URB2P47108 MRP20YDR405W 792 nt9.84□□□□□ -0.83
URB2P47108 XYL2YLR070C 1071 nt9.84□□□□□ -0.83
URB2P47108 YNL024CYNL024C 741 nt9.83□□□□□ -0.84
URB2P47108 ZTA1YBR046C 1005 nt9.83□□□□□ -0.84
URB2P47108 URA6YKL024C 615 nt9.82□□□□□ -0.84
URB2P47108 LEU9YOR108W 1815 nt9.82□□□□□ -0.84
URB2P47108 NRT1YOR071C 1797 nt9.81□□□□□ -0.84
URB2P47108 MET2YNL277W 1461 nt9.81□□□□□ -0.84
URB2P47108 AKR2YOR034C 2250 nt9.8□□□□□ -0.84
URB2P47108 YCR087WYCR087W 516 nt9.8□□□□□ -0.84
URB2P47108 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.8□□□□□ -0.84
URB2P47108 SAM1YLR180W 1149 nt9.8□□□□□ -0.84
URB2P47108 YPL251WYPL251W 303 nt9.8□□□□□ -0.84
URB2P47108 YGL114WYGL114W 2178 nt9.8□□□□□ -0.84
URB2P47108 BRR1YPR057W 1026 nt9.78□□□□□ -0.84
URB2P47108 MSF1YPR047W 1410 nt9.78□□□□□ -0.84
URB2P47108 CWC15YDR163W 528 nt9.77□□□□□ -0.85
URB2P47108 TOA2YKL058W 369 nt9.77□□□□□ -0.85
URB2P47108 UTH1YKR042W 1098 nt9.77□□□□□ -0.85
URB2P47108 ALP1YNL270C 1722 nt9.76□□□□□ -0.85
URB2P47108 RPL4BYDR012W 1089 nt9.76□□□□□ -0.85
URB2P47108 NAT4YMR069W 858 nt9.76□□□□□ -0.85
URB2P47108 RPL4AYBR031W 1089 nt9.76□□□□□ -0.85
URB2P47108 YGL034CYGL034C 366 nt9.75□□□□□ -0.85
URB2P47108 OYE3YPL171C 1203 nt9.75□□□□□ -0.85
URB2P47108 AIM45YPR004C 1035 nt9.75□□□□□ -0.85
URB2P47108 CLB6YGR109C 1143 nt9.74□□□□□ -0.85
URB2P47108 UBX6YJL048C 1191 nt9.74□□□□□ -0.85
URB2P47108 RPS14BYJL191W 417 nt9.74□□□□□ -0.85
URB2P47108 GND2YGR256W 1479 nt9.73□□□□□ -0.85
URB2P47108 SFP1YLR403W 2052 nt9.73□□□□□ -0.85
URB2P47108 SBA1YKL117W 651 nt9.73□□□□□ -0.85
URB2P47108 OPI10YOL032W 741 nt9.72□□□□□ -0.85
URB2P47108 FIT3YOR383C 615 nt9.72□□□□□ -0.85
URB2P47108 PET8YNL003C 855 nt9.71□□□□□ -0.86
URB2P47108 CCT2YIL142W 1584 nt9.71□□□□□ -0.86
URB2P47108 COQ8YGL119W 1506 nt9.7□□□□□ -0.86
URB2P47108 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.69□□□□□ -0.86
URB2P47108 YMR103CYMR103C 363 nt9.69□□□□□ -0.86
URB2P47108 ARO8YGL202W 1503 nt9.68□□□□□ -0.86
URB2P47108 SSN3YPL042C 1668 nt9.67□□□□□ -0.86
URB2P47108 NPP1YCR026C 2229 nt9.67□□□□□ -0.86
URB2P47108 FMS1YMR020W 1527 nt9.66□□□□□ -0.86
URB2P47108 MEP3YPR138C 1470 nt9.66□□□□□ -0.86
URB2P47108 ACH1YBL015W 1581 nt9.66□□□□□ -0.86
URB2P47108 GID7YCL039W 2238 nt9.66□□□□□ -0.86
URB2P47108 LSB6YJL100W 1824 nt9.66□□□□□ -0.86
URB2P47108 UGP1YKL035W 1500 nt9.65□□□□□ -0.86
URB2P47108 SPP2YOR148C 558 nt9.64□□□□□ -0.87
URB2P47108 FLR1YBR008C 1647 nt9.64□□□□□ -0.87
URB2P47108 BET2YPR176C 978 nt9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.5 ms