Protein–RNA interactions for Protein: P47080

YJL007C, Uncharacterized protein YJL007C, yeastyeast

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL007CP47080 YCR102CYCR102C 1107 nt11.45□□□□□ -0.58
YJL007CP47080 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.45□□□□□ -0.58
YJL007CP47080 YJL118WYJL118W 660 nt11.44□□□□□ -0.58
YJL007CP47080 RPL4BYDR012W 1089 nt11.43□□□□□ -0.58
YJL007CP47080 RPL4AYBR031W 1089 nt11.43□□□□□ -0.58
YJL007CP47080 SDH5YOL071W 489 nt11.39□□□□□ -0.59
YJL007CP47080 AGP1YCL025C 1902 nt11.39□□□□□ -0.59
YJL007CP47080 RPS14BYJL191W 417 nt11.38□□□□□ -0.59
YJL007CP47080 CAB5YDR196C 726 nt11.37□□□□□ -0.59
YJL007CP47080 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.37□□□□□ -0.59
YJL007CP47080 ABZ2YMR289W 1125 nt11.37□□□□□ -0.59
YJL007CP47080 RAD23YEL037C 1197 nt11.36□□□□□ -0.59
YJL007CP47080 SHH4YLR164W 507 nt11.36□□□□□ -0.59
YJL007CP47080 YFL054CYFL054C 1941 nt11.35□□□□□ -0.59
YJL007CP47080 COG1YGL223C 1254 nt11.34□□□□□ -0.59
YJL007CP47080 YNR029CYNR029C 1290 nt11.33□□□□□ -0.6
YJL007CP47080 NBP35YGL091C 987 nt11.31□□□□□ -0.6
YJL007CP47080 TOM6YOR045W 186 nt11.3□□□□□ -0.6
YJL007CP47080 STE4YOR212W 1272 nt11.3□□□□□ -0.6
YJL007CP47080 YPL041CYPL041C 624 nt11.3□□□□□ -0.6
YJL007CP47080 CCA1YER168C 1641 nt11.29□□□□□ -0.6
YJL007CP47080 YLR349WYLR349W 507 nt11.29□□□□□ -0.6
YJL007CP47080 TIR3YIL011W 810 nt11.28□□□□□ -0.6
YJL007CP47080 UTH1YKR042W 1098 nt11.28□□□□□ -0.6
YJL007CP47080 FTH1YBR207W 1398 nt11.28□□□□□ -0.6
YJL007CP47080 RIB3YDR487C 627 nt11.26□□□□□ -0.61
YJL007CP47080 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt11.25□□□□□ -0.61
YJL007CP47080 YGR012WYGR012W 1182 nt11.25□□□□□ -0.61
YJL007CP47080 PEX2YJL210W 816 nt11.25□□□□□ -0.61
YJL007CP47080 HIP1YGR191W 1812 nt11.25□□□□□ -0.61
YJL007CP47080 BUR6YER159C 429 nt11.24□□□□□ -0.61
YJL007CP47080 TSC10YBR265W 963 nt11.24□□□□□ -0.61
YJL007CP47080 POM34YLR018C 900 nt11.23□□□□□ -0.61
YJL007CP47080 FUN14YAL008W 597 nt11.22□□□□□ -0.61
YJL007CP47080 NRT1YOR071C 1797 nt11.2□□□□□ -0.62
YJL007CP47080 YJL195CYJL195C 702 nt11.18□□□□□ -0.62
YJL007CP47080 YLR279WYLR279W 390 nt11.18□□□□□ -0.62
YJL007CP47080 ADH7YCR105W 1086 nt11.17□□□□□ -0.62
YJL007CP47080 PAU15YIR041W 375 nt11.17□□□□□ -0.62
YJL007CP47080 PRO1YDR300C 1287 nt11.15□□□□□ -0.62
YJL007CP47080 YML089CYML089C 369 nt11.14□□□□□ -0.63
YJL007CP47080 RSC4YKR008W 1878 nt11.14□□□□□ -0.63
YJL007CP47080 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.13□□□□□ -0.63
YJL007CP47080 ADH1YOL086C 1047 nt11.13□□□□□ -0.63
YJL007CP47080 TIF6YPR016C 738 nt11.13□□□□□ -0.63
YJL007CP47080 STR3YGL184C 1398 nt11.13□□□□□ -0.63
YJL007CP47080 MET28YIR017C 564 nt11.12□□□□□ -0.63
YJL007CP47080 SWE1YJL187C 2460 nt11.12□□□□□ -0.63
YJL007CP47080 LSC2YGR244C 1284 nt11.1□□□□□ -0.63
YJL007CP47080 AQY2YLL052C 450 nt11.1□□□□□ -0.63
YJL007CP47080 MSB4YOL112W 1479 nt11.09□□□□□ -0.63
YJL007CP47080 DUS1YML080W 1272 nt11.09□□□□□ -0.63
YJL007CP47080 YTH1YPR107C 627 nt11.08□□□□□ -0.64
YJL007CP47080 NAS6YGR232W 687 nt11.07□□□□□ -0.64
YJL007CP47080 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt11.07□□□□□ -0.64
YJL007CP47080 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.07□□□□□ -0.64
YJL007CP47080 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.07□□□□□ -0.64
YJL007CP47080 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.07□□□□□ -0.64
YJL007CP47080 SRN2YLR119W 642 nt11.06□□□□□ -0.64
YJL007CP47080 YHM2YMR241W 945 nt11.06□□□□□ -0.64
YJL007CP47080 ATG15YCR068W 1563 nt11.06□□□□□ -0.64
YJL007CP47080 GPN2YOR262W 1044 nt11.05□□□□□ -0.64
YJL007CP47080 BMT5YIL096C 1011 nt11.02□□□□□ -0.65
YJL007CP47080 YPI1YFR003C 468 nt11.01□□□□□ -0.65
YJL007CP47080 FAF1YIL019W 1041 nt11□□□□□ -0.65
YJL007CP47080 PUS5YLR165C 765 nt11□□□□□ -0.65
YJL007CP47080 HMT1YBR034C 1047 nt11□□□□□ -0.65
YJL007CP47080 YEL008WYEL008W 381 nt10.99□□□□□ -0.65
YJL007CP47080 FIT3YOR383C 615 nt10.99□□□□□ -0.65
YJL007CP47080 GND1YHR183W 1470 nt10.97□□□□□ -0.65
YJL007CP47080 ARP6YLR085C 1317 nt10.96□□□□□ -0.65
YJL007CP47080 FHN1YGR131W 525 nt10.96□□□□□ -0.65
YJL007CP47080 LOT5YKL183W 921 nt10.96□□□□□ -0.65
YJL007CP47080 AAC1YMR056C 930 nt10.96□□□□□ -0.65
YJL007CP47080 YCL074WYCL074W 927 nt10.95□□□□□ -0.66
YJL007CP47080 CPD1YGR247W 720 nt10.95□□□□□ -0.66
YJL007CP47080 ESS1YJR017C 513 nt10.95□□□□□ -0.66
YJL007CP47080 GAP1YKR039W 1809 nt10.93□□□□□ -0.66
YJL007CP47080 BNS1YGR230W 414 nt10.92□□□□□ -0.66
YJL007CP47080 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.92□□□□□ -0.66
YJL007CP47080 APT2YDR441C 546 nt10.9□□□□□ -0.66
YJL007CP47080 ATG17YLR423C 1254 nt10.88□□□□□ -0.67
YJL007CP47080 YPL071CYPL071C 471 nt10.88□□□□□ -0.67
YJL007CP47080 KDX1YKL161C 1302 nt10.86□□□□□ -0.67
YJL007CP47080 REC114YMR133W 1287 nt10.85□□□□□ -0.67
YJL007CP47080 SMM1YNR015W 1155 nt10.84□□□□□ -0.67
YJL007CP47080 ZTA1YBR046C 1005 nt10.84□□□□□ -0.67
YJL007CP47080 PLB1YMR008C 1995 nt10.83□□□□□ -0.68
YJL007CP47080 ALP1YNL270C 1722 nt10.82□□□□□ -0.68
YJL007CP47080 NAP1YKR048C 1254 nt10.82□□□□□ -0.68
YJL007CP47080 MAS1YLR163C 1389 nt10.8□□□□□ -0.68
YJL007CP47080 DIF1YLR437C 402 nt10.8□□□□□ -0.68
YJL007CP47080 MTG2YHR168W 1557 nt10.8□□□□□ -0.68
YJL007CP47080 SEN2YLR105C 1134 nt10.79□□□□□ -0.68
YJL007CP47080 YAR028WYAR028W 705 nt10.79□□□□□ -0.68
YJL007CP47080 RIB2YOL066C 1776 nt10.79□□□□□ -0.68
YJL007CP47080 BSP1YPR171W 1731 nt10.78□□□□□ -0.68
YJL007CP47080 PUP1YOR157C 786 nt10.77□□□□□ -0.69
YJL007CP47080 FCY21YER060W 1587 nt10.77□□□□□ -0.69
YJL007CP47080 RTN2YDL204W 1182 nt10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms