Protein–RNA interactions for Protein: P40889

YJL225C, Y' element ATP-dependent helicase YJL225C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL225CP40889 TOM6YOR045W 186 nt12.92□□□□□ -0.34
YJL225CP40889 RAX1YOR301W 1308 nt12.92□□□□□ -0.34
YJL225CP40889 NRT1YOR071C 1797 nt12.89□□□□□ -0.35
YJL225CP40889 TIR3YIL011W 810 nt12.88□□□□□ -0.35
YJL225CP40889 RAD23YEL037C 1197 nt12.87□□□□□ -0.35
YJL225CP40889 STE4YOR212W 1272 nt12.87□□□□□ -0.35
YJL225CP40889 PAU15YIR041W 375 nt12.85□□□□□ -0.35
YJL225CP40889 NBP35YGL091C 987 nt12.84□□□□□ -0.35
YJL225CP40889 TSC10YBR265W 963 nt12.84□□□□□ -0.35
YJL225CP40889 ZTA1YBR046C 1005 nt12.83□□□□□ -0.36
YJL225CP40889 HIP1YGR191W 1812 nt12.81□□□□□ -0.36
YJL225CP40889 UTH1YKR042W 1098 nt12.79□□□□□ -0.36
YJL225CP40889 TIF6YPR016C 738 nt12.76□□□□□ -0.37
YJL225CP40889 ADH1YOL086C 1047 nt12.74□□□□□ -0.37
YJL225CP40889 ATG15YCR068W 1563 nt12.73□□□□□ -0.37
YJL225CP40889 CLB6YGR109C 1143 nt12.73□□□□□ -0.37
YJL225CP40889 FUN14YAL008W 597 nt12.73□□□□□ -0.37
YJL225CP40889 DUS1YML080W 1272 nt12.72□□□□□ -0.37
YJL225CP40889 POM34YLR018C 900 nt12.71□□□□□ -0.37
YJL225CP40889 LOT5YKL183W 921 nt12.69□□□□□ -0.38
YJL225CP40889 AAC1YMR056C 930 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL225CP40889 PRO1YDR300C 1287 nt12.65□□□□□ -0.38
YJL225CP40889 STR3YGL184C 1398 nt12.65□□□□□ -0.38
YJL225CP40889 YCL074WYCL074W 927 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL225CP40889 AKR2YOR034C 2250 nt12.62□□□□□ -0.39
YJL225CP40889 GPN2YOR262W 1044 nt12.61□□□□□ -0.39
YJL225CP40889 DIF1YLR437C 402 nt12.56□□□□□ -0.4
YJL225CP40889 RIB3YDR487C 627 nt12.56□□□□□ -0.4
YJL225CP40889 YJL195CYJL195C 702 nt12.55□□□□□ -0.4
YJL225CP40889 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.54□□□□□ -0.4
YJL225CP40889 UGA4YDL210W 1716 nt12.54□□□□□ -0.4
YJL225CP40889 LSC2YGR244C 1284 nt12.53□□□□□ -0.4
YJL225CP40889 MET28YIR017C 564 nt12.53□□□□□ -0.4
YJL225CP40889 YML089CYML089C 369 nt12.52□□□□□ -0.41
YJL225CP40889 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.52□□□□□ -0.41
YJL225CP40889 ARP6YLR085C 1317 nt12.5□□□□□ -0.41
YJL225CP40889 RTN2YDL204W 1182 nt12.5□□□□□ -0.41
YJL225CP40889 APT2YDR441C 546 nt12.48□□□□□ -0.41
YJL225CP40889 PLB1YMR008C 1995 nt12.48□□□□□ -0.41
YJL225CP40889 YPI1YFR003C 468 nt12.48□□□□□ -0.41
YJL225CP40889 RIB2YOL066C 1776 nt12.48□□□□□ -0.41
YJL225CP40889 GND1YHR183W 1470 nt12.47□□□□□ -0.41
YJL225CP40889 GAP1YKR039W 1809 nt12.46□□□□□ -0.41
YJL225CP40889 CPD1YGR247W 720 nt12.46□□□□□ -0.42
YJL225CP40889 FUR4YBR021W 1902 nt12.44□□□□□ -0.42
YJL225CP40889 YJL055WYJL055W 738 nt12.43□□□□□ -0.42
YJL225CP40889 FIT3YOR383C 615 nt12.43□□□□□ -0.42
YJL225CP40889 UTR1YJR049C 1593 nt12.41□□□□□ -0.42
YJL225CP40889 YAR028WYAR028W 705 nt12.4□□□□□ -0.42
YJL225CP40889 YEL008WYEL008W 381 nt12.39□□□□□ -0.43
YJL225CP40889 PRY1YJL079C 900 nt12.39□□□□□ -0.43
YJL225CP40889 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.39□□□□□ -0.43
YJL225CP40889 SMM1YNR015W 1155 nt12.38□□□□□ -0.43
YJL225CP40889 ESS1YJR017C 513 nt12.38□□□□□ -0.43
YJL225CP40889 SEN2YLR105C 1134 nt12.38□□□□□ -0.43
YJL225CP40889 PRM5YIL117C 957 nt12.35□□□□□ -0.43
YJL225CP40889 ALD4YOR374W 1560 nt12.35□□□□□ -0.43
YJL225CP40889 PUP1YOR157C 786 nt12.34□□□□□ -0.43
YJL225CP40889 MTG2YHR168W 1557 nt12.32□□□□□ -0.44
YJL225CP40889 FCY21YER060W 1587 nt12.3□□□□□ -0.44
YJL225CP40889 YKR005CYKR005C 1578 nt12.28□□□□□ -0.44
YJL225CP40889 MEP3YPR138C 1470 nt12.27□□□□□ -0.45
YJL225CP40889 PGC1YPL206C 966 nt12.26□□□□□ -0.45
YJL225CP40889 HXT12YIL170W 1374 nt12.25□□□□□ -0.45
YJL225CP40889 YGR259CYGR259C 441 nt12.24□□□□□ -0.45
YJL225CP40889 PAU5YFL020C 369 nt12.21□□□□□ -0.45
YJL225CP40889 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.2□□□□□ -0.46
YJL225CP40889 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.2□□□□□ -0.46
YJL225CP40889 YJL118WYJL118W 660 nt12.2□□□□□ -0.46
YJL225CP40889 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.2□□□□□ -0.46
YJL225CP40889 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.2□□□□□ -0.46
YJL225CP40889 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.2□□□□□ -0.46
YJL225CP40889 ALP1YNL270C 1722 nt12.19□□□□□ -0.46
YJL225CP40889 SED1YDR077W 1017 nt12.19□□□□□ -0.46
YJL225CP40889 HSP60YLR259C 1719 nt12.16□□□□□ -0.46
YJL225CP40889 YPL251WYPL251W 303 nt12.15□□□□□ -0.46
YJL225CP40889 VRG4YGL225W 1014 nt12.14□□□□□ -0.47
YJL225CP40889 THI72YOR192C 1800 nt12.13□□□□□ -0.47
YJL225CP40889 YBR232CYBR232C 360 nt12.11□□□□□ -0.47
YJL225CP40889 CCT5YJR064W 1689 nt12.11□□□□□ -0.47
YJL225CP40889 YBL086CYBL086C 1401 nt12.09□□□□□ -0.47
YJL225CP40889 YJL064WYJL064W 396 nt12.07□□□□□ -0.48
YJL225CP40889 SNZ1YMR096W 894 nt12.07□□□□□ -0.48
YJL225CP40889 NAP1YKR048C 1254 nt12.05□□□□□ -0.48
YJL225CP40889 TIP1YBR067C 633 nt12.05□□□□□ -0.48
YJL225CP40889 SLG1YOR008C 1137 nt12.04□□□□□ -0.48
YJL225CP40889 PAU19YMR325W 375 nt12.02□□□□□ -0.48
YJL225CP40889 GAL3YDR009W 1563 nt12.02□□□□□ -0.49
YJL225CP40889 LIP1YMR298W 453 nt12.02□□□□□ -0.49
YJL225CP40889 SAM3YPL274W 1764 nt12.01□□□□□ -0.49
YJL225CP40889 LSB5YCL034W 1065 nt12□□□□□ -0.49
YJL225CP40889 CSM1YCR086W 573 nt11.98□□□□□ -0.49
YJL225CP40889 DBP1YPL119C 1854 nt11.97□□□□□ -0.49
YJL225CP40889 SNF1YDR477W 1902 nt11.95□□□□□ -0.5
YJL225CP40889 SAM35YHR083W 990 nt11.94□□□□□ -0.5
YJL225CP40889 BNI5YNL166C 1347 nt11.94□□□□□ -0.5
YJL225CP40889 YJR114WYJR114W 393 nt11.92□□□□□ -0.5
YJL225CP40889 CDD1YLR245C 429 nt11.92□□□□□ -0.5
YJL225CP40889 IRC24YIR036C 792 nt11.92□□□□□ -0.5
YJL225CP40889 GND2YGR256W 1479 nt11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.4 ms