Protein–RNA interactions for Protein: P40072

SLX8, E3 ubiquitin-protein ligase complex SLX5-SLX8 subunit SLX8, yeastyeast

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX8P40072 HHO1YPL127C 777 nt10.55□□□□□ -0.72
SLX8P40072 SHM2YLR058C 1410 nt10.55□□□□□ -0.72
SLX8P40072 RMA1YKL132C 1293 nt10.54□□□□□ -0.72
SLX8P40072 ATG22YCL038C 1587 nt10.52□□□□□ -0.72
SLX8P40072 IDP3YNL009W 1263 nt10.52□□□□□ -0.73
SLX8P40072 NIT1YIL164C 600 nt10.51□□□□□ -0.73
SLX8P40072 TIM17YJL143W 477 nt10.51□□□□□ -0.73
SLX8P40072 GDH3YAL062W 1374 nt10.49□□□□□ -0.73
SLX8P40072 DTR1YBR180W 1719 nt10.48□□□□□ -0.73
SLX8P40072 ATG17YLR423C 1254 nt10.48□□□□□ -0.73
SLX8P40072 GLK1YCL040W 1503 nt10.46□□□□□ -0.74
SLX8P40072 REC114YMR133W 1287 nt10.45□□□□□ -0.74
SLX8P40072 DUT1YBR252W 444 nt10.45□□□□□ -0.74
SLX8P40072 BNS1YGR230W 414 nt10.44□□□□□ -0.74
SLX8P40072 MIR1YJR077C 936 nt10.44□□□□□ -0.74
SLX8P40072 AAC3YBR085W 924 nt10.44□□□□□ -0.74
SLX8P40072 PAU7YAR020C 168 nt10.43□□□□□ -0.74
SLX8P40072 NAT4YMR069W 858 nt10.43□□□□□ -0.74
SLX8P40072 YMR244WYMR244W 1068 nt10.43□□□□□ -0.74
SLX8P40072 SGT2YOR007C 1041 nt10.42□□□□□ -0.74
SLX8P40072 AVT6YER119C 1347 nt10.39□□□□□ -0.75
SLX8P40072 DAT1YML113W 747 nt10.39□□□□□ -0.75
SLX8P40072 MGM101YJR144W 810 nt10.37□□□□□ -0.75
SLX8P40072 RFC1YOR217W 2586 nt10.36□□□□□ -0.75
SLX8P40072 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt10.36□□□□□ -0.75
SLX8P40072 GOR1YNL274C 1053 nt10.35□□□□□ -0.75
SLX8P40072 FUR4YBR021W 1902 nt10.33□□□□□ -0.76
SLX8P40072 YDR010CYDR010C 333 nt10.33□□□□□ -0.76
SLX8P40072 YDR509WYDR509W 348 nt10.33□□□□□ -0.76
SLX8P40072 ARP10YDR106W 855 nt10.32□□□□□ -0.76
SLX8P40072 THI74YDR438W 1113 nt10.32□□□□□ -0.76
SLX8P40072 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.3□□□□□ -0.76
SLX8P40072 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.3□□□□□ -0.76
SLX8P40072 STR3YGL184C 1398 nt10.3□□□□□ -0.76
SLX8P40072 HDA1YNL021W 2121 nt10.3□□□□□ -0.76
SLX8P40072 SHB17YKR043C 816 nt10.3□□□□□ -0.76
SLX8P40072 ILV2YMR108W 2064 nt10.3□□□□□ -0.76
SLX8P40072 YCL074WYCL074W 927 nt10.29□□□□□ -0.76
SLX8P40072 HMT1YBR034C 1047 nt10.29□□□□□ -0.76
SLX8P40072 MSF1YPR047W 1410 nt10.29□□□□□ -0.76
SLX8P40072 YNL165WYNL165W 1221 nt10.28□□□□□ -0.76
SLX8P40072 SEM1YDR363W-A 270 nt10.27□□□□□ -0.77
SLX8P40072 UBA4YHR111W 1323 nt10.27□□□□□ -0.77
SLX8P40072 YHR131CYHR131C 2553 nt10.26□□□□□ -0.77
SLX8P40072 YCR102CYCR102C 1107 nt10.26□□□□□ -0.77
SLX8P40072 NBP35YGL091C 987 nt10.26□□□□□ -0.77
SLX8P40072 DUS1YML080W 1272 nt10.25□□□□□ -0.77
SLX8P40072 UTP6YDR449C 1323 nt10.25□□□□□ -0.77
SLX8P40072 YHM2YMR241W 945 nt10.24□□□□□ -0.77
SLX8P40072 YJL211CYJL211C 444 nt10.23□□□□□ -0.77
SLX8P40072 HSP60YLR259C 1719 nt10.22□□□□□ -0.77
SLX8P40072 RET2YFR051C 1641 nt10.22□□□□□ -0.77
SLX8P40072 Q0144Q0144 330 nt10.21□□□□□ -0.77
SLX8P40072 MCH5YOR306C 1566 nt10.19□□□□□ -0.78
SLX8P40072 YPL071CYPL071C 471 nt10.17□□□□□ -0.78
SLX8P40072 EEB1YPL095C 1371 nt10.16□□□□□ -0.78
SLX8P40072 HXT10YFL011W 1641 nt10.16□□□□□ -0.78
SLX8P40072 SFA1YDL168W 1161 nt10.16□□□□□ -0.78
SLX8P40072 YGL034CYGL034C 366 nt10.15□□□□□ -0.78
SLX8P40072 YSR3YKR053C 1215 nt10.15□□□□□ -0.78
SLX8P40072 AQY2YLL052C 450 nt10.15□□□□□ -0.78
SLX8P40072 SHH4YLR164W 507 nt10.15□□□□□ -0.78
SLX8P40072 SBA1YKL117W 651 nt10.14□□□□□ -0.79
SLX8P40072 YPL277CYPL277C 1464 nt10.12□□□□□ -0.79
SLX8P40072 TIR3YIL011W 810 nt10.12□□□□□ -0.79
SLX8P40072 YKR023WYKR023W 1593 nt10.12□□□□□ -0.79
SLX8P40072 PHO89YBR296C 1725 nt10.12□□□□□ -0.79
SLX8P40072 YKR005CYKR005C 1578 nt10.11□□□□□ -0.79
SLX8P40072 BOR1YNL275W 1731 nt10.1□□□□□ -0.79
SLX8P40072 ARP6YLR085C 1317 nt10.1□□□□□ -0.79
SLX8P40072 YAT1YAR035W 2064 nt10.1□□□□□ -0.79
SLX8P40072 XYL2YLR070C 1071 nt10.1□□□□□ -0.79
SLX8P40072 PRP4YPR178W 1398 nt10.09□□□□□ -0.79
SLX8P40072 SWP1YMR149W 861 nt10.08□□□□□ -0.8
SLX8P40072 YCR087WYCR087W 516 nt10.07□□□□□ -0.8
SLX8P40072 COQ2YNR041C 1119 nt10.07□□□□□ -0.8
SLX8P40072 RTN2YDL204W 1182 nt10.06□□□□□ -0.8
SLX8P40072 LSC2YGR244C 1284 nt10.06□□□□□ -0.8
SLX8P40072 POM34YLR018C 900 nt10.06□□□□□ -0.8
SLX8P40072 YGR259CYGR259C 441 nt10.05□□□□□ -0.8
SLX8P40072 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.05□□□□□ -0.8
SLX8P40072 DPS1YLL018C 1674 nt10.04□□□□□ -0.8
SLX8P40072 SKG1YKR100C 1068 nt10.03□□□□□ -0.8
SLX8P40072 AIM45YPR004C 1035 nt10.02□□□□□ -0.81
SLX8P40072 NDI1YML120C 1542 nt10.02□□□□□ -0.81
SLX8P40072 MAK32YCR019W 1092 nt10.01□□□□□ -0.81
SLX8P40072 MRP20YDR405W 792 nt10.01□□□□□ -0.81
SLX8P40072 RBG1YAL036C 1110 nt10.01□□□□□ -0.81
SLX8P40072 PET20YPL159C 762 nt10.01□□□□□ -0.81
SLX8P40072 PRO1YDR300C 1287 nt10□□□□□ -0.81
SLX8P40072 PLB1YMR008C 1995 nt9.99□□□□□ -0.81
SLX8P40072 TOM6YOR045W 186 nt9.99□□□□□ -0.81
SLX8P40072 PZF1YPR186C 1290 nt9.99□□□□□ -0.81
SLX8P40072 NPP1YCR026C 2229 nt9.98□□□□□ -0.81
SLX8P40072 YML089CYML089C 369 nt9.97□□□□□ -0.81
SLX8P40072 GLR1YPL091W 1452 nt9.97□□□□□ -0.81
SLX8P40072 HIP1YGR191W 1812 nt9.94□□□□□ -0.82
SLX8P40072 MET2YNL277W 1461 nt9.94□□□□□ -0.82
SLX8P40072 snR78snR78 87 nt9.94□□□□□ -0.82
SLX8P40072 SNF1YDR477W 1902 nt9.94□□□□□ -0.82
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