Protein–RNA interactions for Protein: P39685

POM152, Nucleoporin POM152, yeastyeast

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POM152P39685 SDH5YOL071W 489 nt11.92□□□□□ -0.5
POM152P39685 FUN14YAL008W 597 nt11.91□□□□□ -0.5
POM152P39685 TOM6YOR045W 186 nt11.9□□□□□ -0.5
POM152P39685 GPN2YOR262W 1044 nt11.9□□□□□ -0.5
POM152P39685 STR3YGL184C 1398 nt11.9□□□□□ -0.5
POM152P39685 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.9□□□□□ -0.5
POM152P39685 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.9□□□□□ -0.5
POM152P39685 RPS14BYJL191W 417 nt11.89□□□□□ -0.51
POM152P39685 CLB6YGR109C 1143 nt11.88□□□□□ -0.51
POM152P39685 PEX2YJL210W 816 nt11.87□□□□□ -0.51
POM152P39685 YCL074WYCL074W 927 nt11.86□□□□□ -0.51
POM152P39685 ESS1YJR017C 513 nt11.86□□□□□ -0.51
POM152P39685 UTH1YKR042W 1098 nt11.85□□□□□ -0.51
POM152P39685 YJL195CYJL195C 702 nt11.84□□□□□ -0.51
POM152P39685 POM34YLR018C 900 nt11.84□□□□□ -0.51
POM152P39685 PRO1YDR300C 1287 nt11.82□□□□□ -0.52
POM152P39685 NAP1YKR048C 1254 nt11.82□□□□□ -0.52
POM152P39685 HIP1YGR191W 1812 nt11.81□□□□□ -0.52
POM152P39685 PUP1YOR157C 786 nt11.81□□□□□ -0.52
POM152P39685 NRT1YOR071C 1797 nt11.77□□□□□ -0.53
POM152P39685 ATG15YCR068W 1563 nt11.77□□□□□ -0.53
POM152P39685 SEN2YLR105C 1134 nt11.77□□□□□ -0.53
POM152P39685 YJR114WYJR114W 393 nt11.76□□□□□ -0.53
POM152P39685 YML089CYML089C 369 nt11.76□□□□□ -0.53
POM152P39685 LSC2YGR244C 1284 nt11.75□□□□□ -0.53
POM152P39685 FUR4YBR021W 1902 nt11.74□□□□□ -0.53
POM152P39685 CAB5YDR196C 726 nt11.74□□□□□ -0.53
POM152P39685 RAD23YEL037C 1197 nt11.74□□□□□ -0.53
POM152P39685 YGR012WYGR012W 1182 nt11.74□□□□□ -0.53
POM152P39685 CPD1YGR247W 720 nt11.74□□□□□ -0.53
POM152P39685 TSC10YBR265W 963 nt11.74□□□□□ -0.53
POM152P39685 TIF6YPR016C 738 nt11.73□□□□□ -0.53
POM152P39685 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.72□□□□□ -0.53
POM152P39685 MET28YIR017C 564 nt11.69□□□□□ -0.54
POM152P39685 ARP6YLR085C 1317 nt11.68□□□□□ -0.54
POM152P39685 RTN2YDL204W 1182 nt11.66□□□□□ -0.54
POM152P39685 GAP1YKR039W 1809 nt11.64□□□□□ -0.55
POM152P39685 PLB1YMR008C 1995 nt11.62□□□□□ -0.55
POM152P39685 MSB4YOL112W 1479 nt11.61□□□□□ -0.55
POM152P39685 RIB3YDR487C 627 nt11.6□□□□□ -0.55
POM152P39685 YEL008WYEL008W 381 nt11.6□□□□□ -0.55
POM152P39685 ADH1YOL086C 1047 nt11.57□□□□□ -0.56
POM152P39685 FIT3YOR383C 615 nt11.57□□□□□ -0.56
POM152P39685 BMT6YLR063W 1098 nt11.55□□□□□ -0.56
POM152P39685 YKR005CYKR005C 1578 nt11.53□□□□□ -0.56
POM152P39685 YGR259CYGR259C 441 nt11.52□□□□□ -0.57
POM152P39685 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.52□□□□□ -0.57
POM152P39685 TIM44YIL022W 1296 nt11.5□□□□□ -0.57
POM152P39685 ZTA1YBR046C 1005 nt11.5□□□□□ -0.57
POM152P39685 DIF1YLR437C 402 nt11.49□□□□□ -0.57
POM152P39685 UTR1YJR049C 1593 nt11.47□□□□□ -0.57
POM152P39685 YAR028WYAR028W 705 nt11.47□□□□□ -0.57
POM152P39685 AKR2YOR034C 2250 nt11.47□□□□□ -0.57
POM152P39685 RIB1YBL033C 1038 nt11.45□□□□□ -0.58
POM152P39685 BOR1YNL275W 1731 nt11.45□□□□□ -0.58
POM152P39685 LOT5YKL183W 921 nt11.44□□□□□ -0.58
POM152P39685 HSP60YLR259C 1719 nt11.43□□□□□ -0.58
POM152P39685 YPI1YFR003C 468 nt11.42□□□□□ -0.58
POM152P39685 ERG6YML008C 1152 nt11.42□□□□□ -0.58
POM152P39685 PRP4YPR178W 1398 nt11.42□□□□□ -0.58
POM152P39685 MTG2YHR168W 1557 nt11.41□□□□□ -0.58
POM152P39685 ALP1YNL270C 1722 nt11.41□□□□□ -0.58
POM152P39685 GND1YHR183W 1470 nt11.4□□□□□ -0.58
POM152P39685 YJL064WYJL064W 396 nt11.4□□□□□ -0.58
POM152P39685 SLG1YOR008C 1137 nt11.4□□□□□ -0.58
POM152P39685 AAC1YMR056C 930 nt11.39□□□□□ -0.59
POM152P39685 PAU5YFL020C 369 nt11.36□□□□□ -0.59
POM152P39685 SOD2YHR008C 702 nt11.35□□□□□ -0.59
POM152P39685 PRM5YIL117C 957 nt11.35□□□□□ -0.59
POM152P39685 APT2YDR441C 546 nt11.35□□□□□ -0.59
POM152P39685 PAU19YMR325W 375 nt11.35□□□□□ -0.59
POM152P39685 PGC1YPL206C 966 nt11.35□□□□□ -0.59
POM152P39685 DPS1YLL018C 1674 nt11.34□□□□□ -0.59
POM152P39685 SMM1YNR015W 1155 nt11.32□□□□□ -0.6
POM152P39685 YBR232CYBR232C 360 nt11.32□□□□□ -0.6
POM152P39685 SAM35YHR083W 990 nt11.31□□□□□ -0.6
POM152P39685 UME6YDR207C 2511 nt11.3□□□□□ -0.6
POM152P39685 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.3□□□□□ -0.6
POM152P39685 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.3□□□□□ -0.6
POM152P39685 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.3□□□□□ -0.6
POM152P39685 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.3□□□□□ -0.6
POM152P39685 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.3□□□□□ -0.6
POM152P39685 SED1YDR077W 1017 nt11.28□□□□□ -0.6
POM152P39685 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.26□□□□□ -0.61
POM152P39685 QDR2YIL121W 1629 nt11.26□□□□□ -0.61
POM152P39685 FCY21YER060W 1587 nt11.26□□□□□ -0.61
POM152P39685 UGA4YDL210W 1716 nt11.24□□□□□ -0.61
POM152P39685 RIB2YOL066C 1776 nt11.23□□□□□ -0.61
POM152P39685 PRY1YJL079C 900 nt11.23□□□□□ -0.61
POM152P39685 YIA6YIL006W 1122 nt11.21□□□□□ -0.61
POM152P39685 IRC24YIR036C 792 nt11.21□□□□□ -0.61
POM152P39685 STP3YLR375W 1032 nt11.21□□□□□ -0.61
POM152P39685 LIP1YMR298W 453 nt11.2□□□□□ -0.62
POM152P39685 SNF1YDR477W 1902 nt11.17□□□□□ -0.62
POM152P39685 YPL251WYPL251W 303 nt11.16□□□□□ -0.62
POM152P39685 TIP1YBR067C 633 nt11.16□□□□□ -0.62
POM152P39685 YJL055WYJL055W 738 nt11.14□□□□□ -0.63
POM152P39685 VRG4YGL225W 1014 nt11.13□□□□□ -0.63
POM152P39685 HXT1YHR094C 1713 nt11.12□□□□□ -0.63
POM152P39685 YBL086CYBL086C 1401 nt11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.4 ms