Protein–RNA interactions for Protein: P38798

NMD2, Nonsense-mediated mRNA decay protein 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD2P38798 LSC2YGR244C 1284 nt12.07□□□□□ -0.48
NMD2P38798 COQ2YNR041C 1119 nt12.07□□□□□ -0.48
NMD2P38798 PLB1YMR008C 1995 nt12.07□□□□□ -0.48
NMD2P38798 POM34YLR018C 900 nt12.06□□□□□ -0.48
NMD2P38798 AAC1YMR056C 930 nt12.05□□□□□ -0.48
NMD2P38798 PRO1YDR300C 1287 nt12.04□□□□□ -0.48
NMD2P38798 AIM45YPR004C 1035 nt12.03□□□□□ -0.48
NMD2P38798 SNF1YDR477W 1902 nt12.02□□□□□ -0.49
NMD2P38798 MRP20YDR405W 792 nt12.01□□□□□ -0.49
NMD2P38798 SBA1YKL117W 651 nt12.01□□□□□ -0.49
NMD2P38798 TOM6YOR045W 186 nt12.01□□□□□ -0.49
NMD2P38798 IRC24YIR036C 792 nt12□□□□□ -0.49
NMD2P38798 YML089CYML089C 369 nt11.99□□□□□ -0.49
NMD2P38798 GAP1YKR039W 1809 nt11.97□□□□□ -0.49
NMD2P38798 RBG1YAL036C 1110 nt11.97□□□□□ -0.49
NMD2P38798 ATG15YCR068W 1563 nt11.96□□□□□ -0.49
NMD2P38798 PEX2YJL210W 816 nt11.94□□□□□ -0.5
NMD2P38798 HIP1YGR191W 1812 nt11.93□□□□□ -0.5
NMD2P38798 NDI1YML120C 1542 nt11.91□□□□□ -0.5
NMD2P38798 RPL4BYDR012W 1089 nt11.9□□□□□ -0.5
NMD2P38798 RPL4AYBR031W 1089 nt11.9□□□□□ -0.5
NMD2P38798 TIF6YPR016C 738 nt11.9□□□□□ -0.5
NMD2P38798 UTR1YJR049C 1593 nt11.89□□□□□ -0.51
NMD2P38798 NAR1YNL240C 1476 nt11.88□□□□□ -0.51
NMD2P38798 BIO5YNR056C 1686 nt11.87□□□□□ -0.51
NMD2P38798 RPS14BYJL191W 417 nt11.86□□□□□ -0.51
NMD2P38798 UTH1YKR042W 1098 nt11.85□□□□□ -0.51
NMD2P38798 CLB6YGR109C 1143 nt11.84□□□□□ -0.51
NMD2P38798 PRM5YIL117C 957 nt11.84□□□□□ -0.51
NMD2P38798 MET28YIR017C 564 nt11.81□□□□□ -0.52
NMD2P38798 DIF1YLR437C 402 nt11.81□□□□□ -0.52
NMD2P38798 NRT1YOR071C 1797 nt11.8□□□□□ -0.52
NMD2P38798 GLR1YPL091W 1452 nt11.8□□□□□ -0.52
NMD2P38798 YMR244WYMR244W 1068 nt11.76□□□□□ -0.53
NMD2P38798 HSL7YBR133C 2484 nt11.72□□□□□ -0.53
NMD2P38798 SAM35YHR083W 990 nt11.72□□□□□ -0.53
NMD2P38798 YAR028WYAR028W 705 nt11.7□□□□□ -0.54
NMD2P38798 ALD4YOR374W 1560 nt11.7□□□□□ -0.54
NMD2P38798 HIF1YLL022C 1158 nt11.69□□□□□ -0.54
NMD2P38798 CMP2YML057W 1815 nt11.69□□□□□ -0.54
NMD2P38798 FIT3YOR383C 615 nt11.68□□□□□ -0.54
NMD2P38798 TSC10YBR265W 963 nt11.68□□□□□ -0.54
NMD2P38798 SDH5YOL071W 489 nt11.67□□□□□ -0.54
NMD2P38798 PBP1YGR178C 2169 nt11.66□□□□□ -0.54
NMD2P38798 MTG2YHR168W 1557 nt11.65□□□□□ -0.54
NMD2P38798 ZTA1YBR046C 1005 nt11.64□□□□□ -0.55
NMD2P38798 YLR279WYLR279W 390 nt11.63□□□□□ -0.55
NMD2P38798 YGR012WYGR012W 1182 nt11.62□□□□□ -0.55
NMD2P38798 AKR2YOR034C 2250 nt11.61□□□□□ -0.55
NMD2P38798 ALP1YNL270C 1722 nt11.6□□□□□ -0.55
NMD2P38798 DBP1YPL119C 1854 nt11.59□□□□□ -0.55
NMD2P38798 NME1NME1 340 nt11.58□□□□□ -0.56
NMD2P38798 MSB4YOL112W 1479 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD2P38798 SED1YDR077W 1017 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD2P38798 RAD23YEL037C 1197 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD2P38798 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD2P38798 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD2P38798 YLR111WYLR111W 333 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD2P38798 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD2P38798 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD2P38798 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD2P38798 HEL2YDR266C 1920 nt11.56□□□□□ -0.56
NMD2P38798 CYT2YKL087C 675 nt11.56□□□□□ -0.56
NMD2P38798 CAB5YDR196C 726 nt11.55□□□□□ -0.56
NMD2P38798 RBG2YGR173W 1107 nt11.55□□□□□ -0.56
NMD2P38798 YMR226CYMR226C 804 nt11.55□□□□□ -0.56
NMD2P38798 HXT1YHR094C 1713 nt11.53□□□□□ -0.56
NMD2P38798 LIP1YMR298W 453 nt11.52□□□□□ -0.57
NMD2P38798 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.52□□□□□ -0.57
NMD2P38798 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.52□□□□□ -0.57
NMD2P38798 YBL086CYBL086C 1401 nt11.51□□□□□ -0.57
NMD2P38798 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.47□□□□□ -0.57
NMD2P38798 RIB3YDR487C 627 nt11.46□□□□□ -0.57
NMD2P38798 YPL251WYPL251W 303 nt11.45□□□□□ -0.58
NMD2P38798 SHY1YGR112W 1170 nt11.42□□□□□ -0.58
NMD2P38798 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.42□□□□□ -0.58
NMD2P38798 LEU9YOR108W 1815 nt11.42□□□□□ -0.58
NMD2P38798 ZRT3YKL175W 1512 nt11.41□□□□□ -0.58
NMD2P38798 SAM1YLR180W 1149 nt11.4□□□□□ -0.58
NMD2P38798 BRR1YPR057W 1026 nt11.39□□□□□ -0.59
NMD2P38798 UGA4YDL210W 1716 nt11.38□□□□□ -0.59
NMD2P38798 FCY21YER060W 1587 nt11.37□□□□□ -0.59
NMD2P38798 MET2YNL277W 1461 nt11.37□□□□□ -0.59
NMD2P38798 UFO1YML088W 2007 nt11.36□□□□□ -0.59
NMD2P38798 YAT1YAR035W 2064 nt11.36□□□□□ -0.59
NMD2P38798 TOA2YKL058W 369 nt11.35□□□□□ -0.59
NMD2P38798 MEP3YPR138C 1470 nt11.33□□□□□ -0.6
NMD2P38798 GND1YHR183W 1470 nt11.32□□□□□ -0.6
NMD2P38798 YMR103CYMR103C 363 nt11.32□□□□□ -0.6
NMD2P38798 APT2YDR441C 546 nt11.3□□□□□ -0.6
NMD2P38798 YJL067WYJL067W 351 nt11.3□□□□□ -0.6
NMD2P38798 LOT5YKL183W 921 nt11.3□□□□□ -0.6
NMD2P38798 BSP1YPR171W 1731 nt11.29□□□□□ -0.6
NMD2P38798 URA6YKL024C 615 nt11.29□□□□□ -0.6
NMD2P38798 GND2YGR256W 1479 nt11.28□□□□□ -0.6
NMD2P38798 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.28□□□□□ -0.6
NMD2P38798 SMM1YNR015W 1155 nt11.28□□□□□ -0.6
NMD2P38798 PRY1YJL079C 900 nt11.26□□□□□ -0.61
NMD2P38798 SFP1YLR403W 2052 nt11.26□□□□□ -0.61
NMD2P38798 OYE3YPL171C 1203 nt11.24□□□□□ -0.61
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