Protein–RNA interactions for Protein: P36130

CAF4, CCR4-associated factor 4, yeastyeast

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CAF4P36130 SFA1YDL168W 1161 nt9.66□□□□□ -0.86
CAF4P36130 RET2YFR051C 1641 nt9.66□□□□□ -0.86
CAF4P36130 THI74YDR438W 1113 nt9.65□□□□□ -0.86
CAF4P36130 POM34YLR018C 900 nt9.65□□□□□ -0.86
CAF4P36130 UTR1YJR049C 1593 nt9.65□□□□□ -0.86
CAF4P36130 PHO89YBR296C 1725 nt9.63□□□□□ -0.87
CAF4P36130 ATG15YCR068W 1563 nt9.63□□□□□ -0.87
CAF4P36130 ALD4YOR374W 1560 nt9.6□□□□□ -0.87
CAF4P36130 YSR3YKR053C 1215 nt9.6□□□□□ -0.87
CAF4P36130 NAT4YMR069W 858 nt9.6□□□□□ -0.87
CAF4P36130 TOM6YOR045W 186 nt9.6□□□□□ -0.87
CAF4P36130 HIF1YLL022C 1158 nt9.59□□□□□ -0.87
CAF4P36130 YML089CYML089C 369 nt9.59□□□□□ -0.87
CAF4P36130 MSF1YPR047W 1410 nt9.56□□□□□ -0.88
CAF4P36130 SAM35YHR083W 990 nt9.56□□□□□ -0.88
CAF4P36130 PEX2YJL210W 816 nt9.54□□□□□ -0.88
CAF4P36130 XYL2YLR070C 1071 nt9.53□□□□□ -0.88
CAF4P36130 COQ2YNR041C 1119 nt9.53□□□□□ -0.88
CAF4P36130 MRP20YDR405W 792 nt9.52□□□□□ -0.89
CAF4P36130 YCR087WYCR087W 516 nt9.51□□□□□ -0.89
CAF4P36130 DIF1YLR437C 402 nt9.5□□□□□ -0.89
CAF4P36130 YGL034CYGL034C 366 nt9.49□□□□□ -0.89
CAF4P36130 TIF6YPR016C 738 nt9.49□□□□□ -0.89
CAF4P36130 HIP1YGR191W 1812 nt9.47□□□□□ -0.89
CAF4P36130 YAT1YAR035W 2064 nt9.46□□□□□ -0.89
CAF4P36130 AIM45YPR004C 1035 nt9.44□□□□□ -0.9
CAF4P36130 SSN3YPL042C 1668 nt9.43□□□□□ -0.9
CAF4P36130 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.43□□□□□ -0.9
CAF4P36130 MET28YIR017C 564 nt9.42□□□□□ -0.9
CAF4P36130 RPL4BYDR012W 1089 nt9.41□□□□□ -0.9
CAF4P36130 UTH1YKR042W 1098 nt9.41□□□□□ -0.9
CAF4P36130 RPL4AYBR031W 1089 nt9.41□□□□□ -0.9
CAF4P36130 NRT1YOR071C 1797 nt9.4□□□□□ -0.9
CAF4P36130 CLB6YGR109C 1143 nt9.4□□□□□ -0.9
CAF4P36130 HXT1YHR094C 1713 nt9.39□□□□□ -0.91
CAF4P36130 YAR028WYAR028W 705 nt9.39□□□□□ -0.91
CAF4P36130 ZRT3YKL175W 1512 nt9.38□□□□□ -0.91
CAF4P36130 RBG1YAL036C 1110 nt9.38□□□□□ -0.91
CAF4P36130 DBP1YPL119C 1854 nt9.38□□□□□ -0.91
CAF4P36130 CMP2YML057W 1815 nt9.35□□□□□ -0.91
CAF4P36130 MET2YNL277W 1461 nt9.35□□□□□ -0.91
CAF4P36130 RPS14BYJL191W 417 nt9.35□□□□□ -0.91
CAF4P36130 NDI1YML120C 1542 nt9.35□□□□□ -0.91
CAF4P36130 LIP1YMR298W 453 nt9.34□□□□□ -0.91
CAF4P36130 GID7YCL039W 2238 nt9.33□□□□□ -0.92
CAF4P36130 INA1YLR413W 2028 nt9.33□□□□□ -0.92
CAF4P36130 SED1YDR077W 1017 nt9.33□□□□□ -0.92
CAF4P36130 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.33□□□□□ -0.92
CAF4P36130 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.33□□□□□ -0.92
CAF4P36130 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.33□□□□□ -0.92
CAF4P36130 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.33□□□□□ -0.92
CAF4P36130 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.33□□□□□ -0.92
CAF4P36130 AKR2YOR034C 2250 nt9.32□□□□□ -0.92
CAF4P36130 HEL2YDR266C 1920 nt9.32□□□□□ -0.92
CAF4P36130 MTG2YHR168W 1557 nt9.32□□□□□ -0.92
CAF4P36130 ZTA1YBR046C 1005 nt9.31□□□□□ -0.92
CAF4P36130 HSL7YBR133C 2484 nt9.31□□□□□ -0.92
CAF4P36130 SHY1YGR112W 1170 nt9.3□□□□□ -0.92
CAF4P36130 FIT3YOR383C 615 nt9.3□□□□□ -0.92
CAF4P36130 YBL086CYBL086C 1401 nt9.3□□□□□ -0.92
CAF4P36130 YJL067WYJL067W 351 nt9.29□□□□□ -0.92
CAF4P36130 ALP1YNL270C 1722 nt9.28□□□□□ -0.92
CAF4P36130 RPC82YPR190C 1965 nt9.28□□□□□ -0.92
CAF4P36130 SPT20YOL148C 1815 nt9.26□□□□□ -0.93
CAF4P36130 SAM1YLR180W 1149 nt9.25□□□□□ -0.93
CAF4P36130 SDH5YOL071W 489 nt9.23□□□□□ -0.93
CAF4P36130 TOA2YKL058W 369 nt9.22□□□□□ -0.93
CAF4P36130 TSC10YBR265W 963 nt9.22□□□□□ -0.93
CAF4P36130 YPL251WYPL251W 303 nt9.21□□□□□ -0.94
CAF4P36130 LEU9YOR108W 1815 nt9.2□□□□□ -0.94
CAF4P36130 BRR1YPR057W 1026 nt9.2□□□□□ -0.94
CAF4P36130 SFP1YLR403W 2052 nt9.2□□□□□ -0.94
CAF4P36130 URA6YKL024C 615 nt9.19□□□□□ -0.94
CAF4P36130 SBA1YKL117W 651 nt9.19□□□□□ -0.94
CAF4P36130 FRE6YLL051C 2139 nt9.19□□□□□ -0.94
CAF4P36130 NPP1YCR026C 2229 nt9.18□□□□□ -0.94
CAF4P36130 YLR279WYLR279W 390 nt9.18□□□□□ -0.94
CAF4P36130 UFO1YML088W 2007 nt9.17□□□□□ -0.94
CAF4P36130 GND2YGR256W 1479 nt9.16□□□□□ -0.94
CAF4P36130 YGR012WYGR012W 1182 nt9.16□□□□□ -0.94
CAF4P36130 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.16□□□□□ -0.94
CAF4P36130 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.16□□□□□ -0.94
CAF4P36130 MEP3YPR138C 1470 nt9.15□□□□□ -0.95
CAF4P36130 YMR103CYMR103C 363 nt9.14□□□□□ -0.95
CAF4P36130 OYE3YPL171C 1203 nt9.14□□□□□ -0.95
CAF4P36130 MSB4YOL112W 1479 nt9.14□□□□□ -0.95
CAF4P36130 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.12□□□□□ -0.95
CAF4P36130 CWC15YDR163W 528 nt9.11□□□□□ -0.95
CAF4P36130 PET8YNL003C 855 nt9.1□□□□□ -0.95
CAF4P36130 GLR1YPL091W 1452 nt9.09□□□□□ -0.95
CAF4P36130 UGA4YDL210W 1716 nt9.09□□□□□ -0.95
CAF4P36130 SAM2YDR502C 1155 nt9.07□□□□□ -0.96
CAF4P36130 RAD23YEL037C 1197 nt9.06□□□□□ -0.96
CAF4P36130 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.06□□□□□ -0.96
CAF4P36130 YLR111WYLR111W 333 nt9.06□□□□□ -0.96
CAF4P36130 YOR325WYOR325W 474 nt9.05□□□□□ -0.96
CAF4P36130 YNL024CYNL024C 741 nt9.04□□□□□ -0.96
CAF4P36130 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.03□□□□□ -0.96
CAF4P36130 ILV3YJR016C 1758 nt9.03□□□□□ -0.96
CAF4P36130 BSP1YPR171W 1731 nt9.02□□□□□ -0.96
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