Protein–RNA interactions for Protein: P27344

DPB3, DNA polymerase epsilon subunit C, yeastyeast

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB3P27344 SSN3YPL042C 1668 nt10.53□□□□□ -0.72
DPB3P27344 ATG15YCR068W 1563 nt10.52□□□□□ -0.73
DPB3P27344 POM34YLR018C 900 nt10.51□□□□□ -0.73
DPB3P27344 PAU7YAR020C 168 nt10.49□□□□□ -0.73
DPB3P27344 YJL067WYJL067W 351 nt10.47□□□□□ -0.73
DPB3P27344 ADO1YJR105W 1023 nt10.47□□□□□ -0.73
DPB3P27344 UBX6YJL048C 1191 nt10.45□□□□□ -0.74
DPB3P27344 MRPL8YJL063C 717 nt10.44□□□□□ -0.74
DPB3P27344 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.43□□□□□ -0.74
DPB3P27344 DIF1YLR437C 402 nt10.43□□□□□ -0.74
DPB3P27344 YML089CYML089C 369 nt10.43□□□□□ -0.74
DPB3P27344 HXT1YHR094C 1713 nt10.43□□□□□ -0.74
DPB3P27344 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.42□□□□□ -0.74
DPB3P27344 TOM6YOR045W 186 nt10.42□□□□□ -0.74
DPB3P27344 SFA1YDL168W 1161 nt10.41□□□□□ -0.74
DPB3P27344 YDR010CYDR010C 333 nt10.41□□□□□ -0.74
DPB3P27344 DBP1YPL119C 1854 nt10.4□□□□□ -0.74
DPB3P27344 YFR018CYFR018C 1092 nt10.4□□□□□ -0.74
DPB3P27344 SHB17YKR043C 816 nt10.4□□□□□ -0.74
DPB3P27344 MUP1YGR055W 1725 nt10.4□□□□□ -0.74
DPB3P27344 RIM8YGL045W 1629 nt10.4□□□□□ -0.75
DPB3P27344 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.39□□□□□ -0.75
DPB3P27344 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.39□□□□□ -0.75
DPB3P27344 SHY1YGR112W 1170 nt10.36□□□□□ -0.75
DPB3P27344 PRE6YOL038W 765 nt10.36□□□□□ -0.75
DPB3P27344 RET2YFR051C 1641 nt10.33□□□□□ -0.76
DPB3P27344 HOL1YNR055C 1761 nt10.33□□□□□ -0.76
DPB3P27344 PEX2YJL210W 816 nt10.32□□□□□ -0.76
DPB3P27344 YNL024CYNL024C 741 nt10.32□□□□□ -0.76
DPB3P27344 HEL2YDR266C 1920 nt10.32□□□□□ -0.76
DPB3P27344 TIF6YPR016C 738 nt10.3□□□□□ -0.76
DPB3P27344 LIP1YMR298W 453 nt10.29□□□□□ -0.76
DPB3P27344 YBL086CYBL086C 1401 nt10.29□□□□□ -0.76
DPB3P27344 MAS1YLR163C 1389 nt10.28□□□□□ -0.76
DPB3P27344 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
DPB3P27344 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
DPB3P27344 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
DPB3P27344 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
DPB3P27344 YOR325WYOR325W 474 nt10.28□□□□□ -0.76
DPB3P27344 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
DPB3P27344 YGL114WYGL114W 2178 nt10.28□□□□□ -0.76
DPB3P27344 PHO89YBR296C 1725 nt10.27□□□□□ -0.76
DPB3P27344 ILV3YJR016C 1758 nt10.26□□□□□ -0.77
DPB3P27344 SED1YDR077W 1017 nt10.25□□□□□ -0.77
DPB3P27344 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.25□□□□□ -0.77
DPB3P27344 MIR1YJR077C 936 nt10.25□□□□□ -0.77
DPB3P27344 YAR028WYAR028W 705 nt10.25□□□□□ -0.77
DPB3P27344 UBA4YHR111W 1323 nt10.24□□□□□ -0.77
DPB3P27344 HIP1YGR191W 1812 nt10.23□□□□□ -0.77
DPB3P27344 CWC15YDR163W 528 nt10.22□□□□□ -0.77
DPB3P27344 MRP20YDR405W 792 nt10.21□□□□□ -0.77
DPB3P27344 URA6YKL024C 615 nt10.21□□□□□ -0.77
DPB3P27344 SAM1YLR180W 1149 nt10.2□□□□□ -0.78
DPB3P27344 MET28YIR017C 564 nt10.19□□□□□ -0.78
DPB3P27344 COQ2YNR041C 1119 nt10.19□□□□□ -0.78
DPB3P27344 MTG2YHR168W 1557 nt10.18□□□□□ -0.78
DPB3P27344 RRT5YFR032C 870 nt10.18□□□□□ -0.78
DPB3P27344 TOA2YKL058W 369 nt10.17□□□□□ -0.78
DPB3P27344 YSR3YKR053C 1215 nt10.17□□□□□ -0.78
DPB3P27344 UFO1YML088W 2007 nt10.17□□□□□ -0.78
DPB3P27344 AKR2YOR034C 2250 nt10.16□□□□□ -0.78
DPB3P27344 BRR1YPR057W 1026 nt10.15□□□□□ -0.78
DPB3P27344 LEU9YOR108W 1815 nt10.14□□□□□ -0.79
DPB3P27344 COQ8YGL119W 1506 nt10.14□□□□□ -0.79
DPB3P27344 OPI10YOL032W 741 nt10.14□□□□□ -0.79
DPB3P27344 ZTA1YBR046C 1005 nt10.13□□□□□ -0.79
DPB3P27344 OYE3YPL171C 1203 nt10.13□□□□□ -0.79
DPB3P27344 YPL251WYPL251W 303 nt10.13□□□□□ -0.79
DPB3P27344 NRT1YOR071C 1797 nt10.13□□□□□ -0.79
DPB3P27344 CCT2YIL142W 1584 nt10.13□□□□□ -0.79
DPB3P27344 THI74YDR438W 1113 nt10.12□□□□□ -0.79
DPB3P27344 HIS2YFR025C 1008 nt10.11□□□□□ -0.79
DPB3P27344 PET8YNL003C 855 nt10.11□□□□□ -0.79
DPB3P27344 GND2YGR256W 1479 nt10.1□□□□□ -0.79
DPB3P27344 BET2YPR176C 978 nt10.1□□□□□ -0.79
DPB3P27344 ARO8YGL202W 1503 nt10.1□□□□□ -0.79
DPB3P27344 YCR087WYCR087W 516 nt10.09□□□□□ -0.79
DPB3P27344 ALP1YNL270C 1722 nt10.08□□□□□ -0.8
DPB3P27344 UTH1YKR042W 1098 nt10.08□□□□□ -0.8
DPB3P27344 YMR209CYMR209C 1374 nt10.08□□□□□ -0.8
DPB3P27344 UGP1YKL035W 1500 nt10.07□□□□□ -0.8
DPB3P27344 PAU16YKL224C 372 nt10.07□□□□□ -0.8
DPB3P27344 XYL2YLR070C 1071 nt10.07□□□□□ -0.8
DPB3P27344 YDR094WYDR094W 336 nt10.06□□□□□ -0.8
DPB3P27344 CLB6YGR109C 1143 nt10.06□□□□□ -0.8
DPB3P27344 GID7YCL039W 2238 nt10.06□□□□□ -0.8
DPB3P27344 KES1YPL145C 1305 nt10.06□□□□□ -0.8
DPB3P27344 RPL4BYDR012W 1089 nt10.05□□□□□ -0.8
DPB3P27344 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.05□□□□□ -0.8
DPB3P27344 RPL4AYBR031W 1089 nt10.05□□□□□ -0.8
DPB3P27344 YMR103CYMR103C 363 nt10.04□□□□□ -0.8
DPB3P27344 SPP2YOR148C 558 nt10.04□□□□□ -0.8
DPB3P27344 FIT3YOR383C 615 nt10.04□□□□□ -0.8
DPB3P27344 MEP3YPR138C 1470 nt10.04□□□□□ -0.8
DPB3P27344 MAE1YKL029C 2010 nt10.02□□□□□ -0.8
DPB3P27344 SBA1YKL117W 651 nt10.02□□□□□ -0.81
DPB3P27344 FMS1YMR020W 1527 nt10.02□□□□□ -0.81
DPB3P27344 LSB6YJL100W 1824 nt10.01□□□□□ -0.81
DPB3P27344 SGA1YIL099W 1650 nt10.01□□□□□ -0.81
DPB3P27344 MCM5YLR274W 2328 nt10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms