Protein–RNA interactions for Protein: P25579

LRE1, Laminarase-resistance protein LRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LRE1P25579 TOM6YOR045W 186 nt10.42□□□□□ -0.74
LRE1P25579 CLB6YGR109C 1143 nt10.41□□□□□ -0.74
LRE1P25579 YMR226CYMR226C 804 nt10.4□□□□□ -0.74
LRE1P25579 PRO1YDR300C 1287 nt10.39□□□□□ -0.75
LRE1P25579 RPS14BYJL191W 417 nt10.39□□□□□ -0.75
LRE1P25579 HIP1YGR191W 1812 nt10.39□□□□□ -0.75
LRE1P25579 RTN2YDL204W 1182 nt10.38□□□□□ -0.75
LRE1P25579 UTH1YKR042W 1098 nt10.37□□□□□ -0.75
LRE1P25579 PEX2YJL210W 816 nt10.35□□□□□ -0.75
LRE1P25579 TIF6YPR016C 738 nt10.33□□□□□ -0.76
LRE1P25579 ATG15YCR068W 1563 nt10.33□□□□□ -0.76
LRE1P25579 HSP60YLR259C 1719 nt10.32□□□□□ -0.76
LRE1P25579 YKR005CYKR005C 1578 nt10.31□□□□□ -0.76
LRE1P25579 MET28YIR017C 564 nt10.31□□□□□ -0.76
LRE1P25579 NRT1YOR071C 1797 nt10.31□□□□□ -0.76
LRE1P25579 GAP1YKR039W 1809 nt10.3□□□□□ -0.76
LRE1P25579 PLB1YMR008C 1995 nt10.3□□□□□ -0.76
LRE1P25579 YGR259CYGR259C 441 nt10.29□□□□□ -0.76
LRE1P25579 YLR111WYLR111W 333 nt10.28□□□□□ -0.76
LRE1P25579 RAD23YEL037C 1197 nt10.27□□□□□ -0.77
LRE1P25579 TSC10YBR265W 963 nt10.27□□□□□ -0.77
LRE1P25579 PRP4YPR178W 1398 nt10.26□□□□□ -0.77
LRE1P25579 SDH5YOL071W 489 nt10.26□□□□□ -0.77
LRE1P25579 NVJ2YPR091C 2313 nt10.25□□□□□ -0.77
LRE1P25579 YGR012WYGR012W 1182 nt10.22□□□□□ -0.77
LRE1P25579 FIT3YOR383C 615 nt10.22□□□□□ -0.77
LRE1P25579 DPS1YLL018C 1674 nt10.19□□□□□ -0.78
LRE1P25579 BMT6YLR063W 1098 nt10.18□□□□□ -0.78
LRE1P25579 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.18□□□□□ -0.78
LRE1P25579 BOR1YNL275W 1731 nt10.17□□□□□ -0.78
LRE1P25579 YLR279WYLR279W 390 nt10.17□□□□□ -0.78
LRE1P25579 DIF1YLR437C 402 nt10.17□□□□□ -0.78
LRE1P25579 RIB3YDR487C 627 nt10.16□□□□□ -0.78
LRE1P25579 UTR1YJR049C 1593 nt10.16□□□□□ -0.78
LRE1P25579 CAB5YDR196C 726 nt10.14□□□□□ -0.79
LRE1P25579 SAM1YLR180W 1149 nt10.14□□□□□ -0.79
LRE1P25579 IRC24YIR036C 792 nt10.13□□□□□ -0.79
LRE1P25579 YAR028WYAR028W 705 nt10.12□□□□□ -0.79
LRE1P25579 MSB4YOL112W 1479 nt10.1□□□□□ -0.79
LRE1P25579 ALP1YNL270C 1722 nt10.09□□□□□ -0.79
LRE1P25579 MTG2YHR168W 1557 nt10.08□□□□□ -0.8
LRE1P25579 AAC1YMR056C 930 nt10.07□□□□□ -0.8
LRE1P25579 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.06□□□□□ -0.8
LRE1P25579 SAM35YHR083W 990 nt10.04□□□□□ -0.8
LRE1P25579 ZTA1YBR046C 1005 nt10.04□□□□□ -0.8
LRE1P25579 PRM5YIL117C 957 nt10.03□□□□□ -0.8
LRE1P25579 SNF1YDR477W 1902 nt10.03□□□□□ -0.8
LRE1P25579 AKR2YOR034C 2250 nt10.02□□□□□ -0.81
LRE1P25579 GND1YHR183W 1470 nt9.97□□□□□ -0.81
LRE1P25579 SED1YDR077W 1017 nt9.96□□□□□ -0.82
LRE1P25579 FCY21YER060W 1587 nt9.94□□□□□ -0.82
LRE1P25579 ALD4YOR374W 1560 nt9.93□□□□□ -0.82
LRE1P25579 YPI1YFR003C 468 nt9.93□□□□□ -0.82
LRE1P25579 DBP1YPL119C 1854 nt9.93□□□□□ -0.82
LRE1P25579 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.92□□□□□ -0.82
LRE1P25579 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.92□□□□□ -0.82
LRE1P25579 LOT5YKL183W 921 nt9.92□□□□□ -0.82
LRE1P25579 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.92□□□□□ -0.82
LRE1P25579 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.92□□□□□ -0.82
LRE1P25579 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.92□□□□□ -0.82
LRE1P25579 APT2YDR441C 546 nt9.91□□□□□ -0.82
LRE1P25579 ADH1YOL086C 1047 nt9.91□□□□□ -0.82
LRE1P25579 LIP1YMR298W 453 nt9.9□□□□□ -0.82
LRE1P25579 HIF1YLL022C 1158 nt9.88□□□□□ -0.83
LRE1P25579 SMM1YNR015W 1155 nt9.88□□□□□ -0.83
LRE1P25579 FUN14YAL008W 597 nt9.87□□□□□ -0.83
LRE1P25579 YNR029CYNR029C 1290 nt9.87□□□□□ -0.83
LRE1P25579 YJL195CYJL195C 702 nt9.86□□□□□ -0.83
LRE1P25579 BIO5YNR056C 1686 nt9.86□□□□□ -0.83
LRE1P25579 HXT1YHR094C 1713 nt9.85□□□□□ -0.83
LRE1P25579 YBL086CYBL086C 1401 nt9.84□□□□□ -0.83
LRE1P25579 UGA4YDL210W 1716 nt9.84□□□□□ -0.83
LRE1P25579 LEU9YOR108W 1815 nt9.84□□□□□ -0.83
LRE1P25579 ALG12YNR030W 1656 nt9.83□□□□□ -0.84
LRE1P25579 YPL251WYPL251W 303 nt9.82□□□□□ -0.84
LRE1P25579 STE4YOR212W 1272 nt9.81□□□□□ -0.84
LRE1P25579 RAD51YER095W 1203 nt9.8□□□□□ -0.84
LRE1P25579 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.79□□□□□ -0.84
LRE1P25579 PRY1YJL079C 900 nt9.79□□□□□ -0.84
LRE1P25579 YLR349WYLR349W 507 nt9.79□□□□□ -0.84
LRE1P25579 HXT12YIL170W 1374 nt9.78□□□□□ -0.84
LRE1P25579 BRR1YPR057W 1026 nt9.78□□□□□ -0.84
LRE1P25579 YEL008WYEL008W 381 nt9.74□□□□□ -0.85
LRE1P25579 MEP3YPR138C 1470 nt9.73□□□□□ -0.85
LRE1P25579 RIB2YOL066C 1776 nt9.73□□□□□ -0.85
LRE1P25579 SHY1YGR112W 1170 nt9.73□□□□□ -0.85
LRE1P25579 TOA2YKL058W 369 nt9.72□□□□□ -0.85
LRE1P25579 YMR103CYMR103C 363 nt9.72□□□□□ -0.85
LRE1P25579 UFO1YML088W 2007 nt9.71□□□□□ -0.86
LRE1P25579 ZRT3YKL175W 1512 nt9.7□□□□□ -0.86
LRE1P25579 CSM1YCR086W 573 nt9.69□□□□□ -0.86
LRE1P25579 VRG4YGL225W 1014 nt9.69□□□□□ -0.86
LRE1P25579 PBP1YGR178C 2169 nt9.68□□□□□ -0.86
LRE1P25579 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.68□□□□□ -0.86
LRE1P25579 URA6YKL024C 615 nt9.67□□□□□ -0.86
LRE1P25579 GND2YGR256W 1479 nt9.66□□□□□ -0.86
LRE1P25579 PHO23YNL097C 993 nt9.65□□□□□ -0.86
LRE1P25579 SSN3YPL042C 1668 nt9.64□□□□□ -0.87
LRE1P25579 ADH7YCR105W 1086 nt9.64□□□□□ -0.87
LRE1P25579 YJL055WYJL055W 738 nt9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.5 ms