Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh3P10287 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh3P10287 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh3P10287 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh3P10287 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh3P10287 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh3P10287 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh3P10287 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh3P10287 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh3P10287 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh3P10287 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh3P10287 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh3P10287 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh3P10287 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh3P10287 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh3P10287 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh3P10287 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh3P10287 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh3P10287 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh3P10287 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh3P10287 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh3P10287 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh3P10287 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh3P10287 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh3P10287 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh3P10287 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh3P10287 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh3P10287 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh3P10287 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh3P10287 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh3P10287 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh3P10287 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh3P10287 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh3P10287 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh3P10287 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh3P10287 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh3P10287 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh3P10287 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh3P10287 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh3P10287 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh3P10287 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh3P10287 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh3P10287 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh3P10287 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms