Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Cdh3P10287 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdh3P10287 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdh3P10287 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdh3P10287 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdh3P10287 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdh3P10287 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdh3P10287 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdh3P10287 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdh3P10287 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdh3P10287 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdh3P10287 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdh3P10287 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdh3P10287 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdh3P10287 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdh3P10287 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdh3P10287 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdh3P10287 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdh3P10287 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdh3P10287 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdh3P10287 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdh3P10287 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdh3P10287 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdh3P10287 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdh3P10287 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdh3P10287 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdh3P10287 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdh3P10287 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdh3P10287 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdh3P10287 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdh3P10287 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdh3P10287 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdh3P10287 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdh3P10287 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdh3P10287 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdh3P10287 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdh3P10287 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdh3P10287 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdh3P10287 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdh3P10287 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdh3P10287 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdh3P10287 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdh3P10287 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdh3P10287 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdh3P10287 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdh3P10287 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdh3P10287 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdh3P10287 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdh3P10287 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdh3P10287 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdh3P10287 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdh3P10287 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdh3P10287 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdh3P10287 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdh3P10287 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdh3P10287 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdh3P10287 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdh3P10287 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdh3P10287 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdh3P10287 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdh3P10287 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdh3P10287 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdh3P10287 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdh3P10287 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdh3P10287 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdh3P10287 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh3P10287 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdh3P10287 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdh3P10287 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdh3P10287 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdh3P10287 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdh3P10287 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdh3P10287 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh3P10287 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh3P10287 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdh3P10287 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdh3P10287 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdh3P10287 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh3P10287 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdh3P10287 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdh3P10287 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdh3P10287 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdh3P10287 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh3P10287 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh3P10287 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh3P10287 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh3P10287 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdh3P10287 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdh3P10287 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdh3P10287 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh3P10287 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh3P10287 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdh3P10287 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdh3P10287 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdh3P10287 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh3P10287 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh3P10287 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh3P10287 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh3P10287 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdh3P10287 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms