Protein–RNA interactions for Protein: P0CX42

RPL23B, 60S ribosomal protein L23-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL23BP0CX42 TIR3YIL011W 810 nt7.59□□□□□ -1.19
RPL23BP0CX42 DBP1YPL119C 1854 nt7.56□□□□□ -1.2
RPL23BP0CX42 YNL024CYNL024C 741 nt7.56□□□□□ -1.2
RPL23BP0CX42 PRO1YDR300C 1287 nt7.54□□□□□ -1.2
RPL23BP0CX42 HXT1YHR094C 1713 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL23BP0CX42 SHH4YLR164W 507 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL23BP0CX42 YOR325WYOR325W 474 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt7.51□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 SHY1YGR112W 1170 nt7.5□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 POM34YLR018C 900 nt7.5□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 ACO2YJL200C 2370 nt7.49□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 YNL115CYNL115C 1935 nt7.49□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 DIF1YLR437C 402 nt7.49□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 COQ8YGL119W 1506 nt7.48□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 ATG15YCR068W 1563 nt7.48□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 HIS2YFR025C 1008 nt7.48□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 RTG1YOL067C 534 nt7.48□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 OPI10YOL032W 741 nt7.47□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 YMR209CYMR209C 1374 nt7.46□□□□□ -1.21
RPL23BP0CX42 YML089CYML089C 369 nt7.46□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 UGP1YKL035W 1500 nt7.46□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 VPS75YNL246W 795 nt7.45□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 BSP1YPR171W 1731 nt7.44□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 PEX25YPL112C 1185 nt7.43□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 MET2YNL277W 1461 nt7.43□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 ARO8YGL202W 1503 nt7.42□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 RET2YFR051C 1641 nt7.42□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 YBL086CYBL086C 1401 nt7.42□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 CCT2YIL142W 1584 nt7.42□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 CWC15YDR163W 528 nt7.41□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 URA6YKL024C 615 nt7.41□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 KES1YPL145C 1305 nt7.4□□□□□ -1.22
RPL23BP0CX42 SGA1YIL099W 1650 nt7.39□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 MRP20YDR405W 792 nt7.39□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 LIP1YMR298W 453 nt7.39□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 UFO1YML088W 2007 nt7.37□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 SED1YDR077W 1017 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 PRE6YOL038W 765 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 TOM6YOR045W 186 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 LSB6YJL100W 1824 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 SFA1YDL168W 1161 nt7.35□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 HUA1YGR268C 597 nt7.35□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.35□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 SFP1YLR403W 2052 nt7.35□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 ZAP1YJL056C 2643 nt7.35□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 YAR028WYAR028W 705 nt7.34□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 BET2YPR176C 978 nt7.34□□□□□ -1.23
RPL23BP0CX42 LEU9YOR108W 1815 nt7.34□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 PSD1YNL169C 1503 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 YHL008CYHL008C 1884 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 TIF6YPR016C 738 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 SSN3YPL042C 1668 nt7.32□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 YFL066CYFL066C 1179 nt7.32□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 YDR010CYDR010C 333 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 SAM1YLR180W 1149 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 PET8YNL003C 855 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 OYE3YPL171C 1203 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 PAU7YAR020C 168 nt7.3□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 DMA2YNL116W 1569 nt7.29□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 RSC8YFR037C 1674 nt7.29□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 CYT1YOR065W 930 nt7.29□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 HMG2YLR450W 3138 nt7.29□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 UGA4YDL210W 1716 nt7.28□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 MTG2YHR168W 1557 nt7.28□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 ACH1YBL015W 1581 nt7.28□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 TPO4YOR273C 1980 nt7.28□□□□□ -1.24
RPL23BP0CX42 HIP1YGR191W 1812 nt7.27□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 TOA2YKL058W 369 nt7.27□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 ZTA1YBR046C 1005 nt7.27□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 BRR1YPR057W 1026 nt7.27□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 PEX2YJL210W 816 nt7.26□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 YPL251WYPL251W 303 nt7.26□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.25□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 SHB17YKR043C 816 nt7.25□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 QDR2YIL121W 1629 nt7.24□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 FMS1YMR020W 1527 nt7.24□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.24□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 SPP2YOR148C 558 nt7.24□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 MET28YIR017C 564 nt7.23□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 ODC1YPL134C 933 nt7.23□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 YHR218WYHR218W 1812 nt7.22□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 YRF1-2YER190W 5046 nt7.22□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 GND2YGR256W 1479 nt7.22□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 VPS62YGR141W 1404 nt7.21□□□□□ -1.25
RPL23BP0CX42 YDL086WYDL086W 822 nt7.21□□□□□ -1.26
RPL23BP0CX42 DIG1YPL049C 1359 nt7.2□□□□□ -1.26
RPL23BP0CX42 UBX6YJL048C 1191 nt7.2□□□□□ -1.26
RPL23BP0CX42 ALP1YNL270C 1722 nt7.2□□□□□ -1.26
RPL23BP0CX42 AKR2YOR034C 2250 nt7.2□□□□□ -1.26
RPL23BP0CX42 SSL2YIL143C 2532 nt7.2□□□□□ -1.26
RPL23BP0CX42 YPS3YLR121C 1527 nt7.19□□□□□ -1.26
RPL23BP0CX42 YFR018CYFR018C 1092 nt7.19□□□□□ -1.26
RPL23BP0CX42 GID8YMR135C 1368 nt7.19□□□□□ -1.26
RPL23BP0CX42 FLR1YBR008C 1647 nt7.17□□□□□ -1.26
RPL23BP0CX42 PHO89YBR296C 1725 nt7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms