Protein–RNA interactions for Protein: O43325

LYRM1, LYR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM1O43325 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms