Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB1P1B2RPK0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB1P1B2RPK0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB1P1B2RPK0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB1P1B2RPK0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB1P1B2RPK0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB1P1B2RPK0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMGB1P1B2RPK0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGB1P1B2RPK0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGB1P1B2RPK0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGB1P1B2RPK0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGB1P1B2RPK0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMGB1P1B2RPK0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB1P1B2RPK0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB1P1B2RPK0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB1P1B2RPK0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB1P1B2RPK0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB1P1B2RPK0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB1P1B2RPK0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB1P1B2RPK0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB1P1B2RPK0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB1P1B2RPK0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB1P1B2RPK0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HMGB1P1B2RPK0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB1P1B2RPK0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB1P1B2RPK0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB1P1B2RPK0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGB1P1B2RPK0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGB1P1B2RPK0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGB1P1B2RPK0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGB1P1B2RPK0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HMGB1P1B2RPK0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HMGB1P1B2RPK0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HMGB1P1B2RPK0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMGB1P1B2RPK0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMGB1P1B2RPK0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB1P1B2RPK0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB1P1B2RPK0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB1P1B2RPK0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGB1P1B2RPK0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGB1P1B2RPK0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGB1P1B2RPK0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMGB1P1B2RPK0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMGB1P1B2RPK0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMGB1P1B2RPK0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMGB1P1B2RPK0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMGB1P1B2RPK0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMGB1P1B2RPK0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMGB1P1B2RPK0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMGB1P1B2RPK0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB1P1B2RPK0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB1P1B2RPK0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB1P1B2RPK0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB1P1B2RPK0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMGB1P1B2RPK0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms