Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AP006222.1-203ENST00000441866 2256 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 POLH-202ENST00000372236 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL645922.1-202ENST00000477310 3377 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SLC38A11-201ENST00000303735 3737 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 FAM162A-203ENST00000477892 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RHOXF2-201ENST00000371388 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 GATD1-201ENST00000319863 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ICAM1-201ENST00000264832 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ABCD4-201ENST00000356924 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MROH7-206ENST00000421030 4329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ATP1A3-209ENST00000602133 3458 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BCL6-206ENST00000450123 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 DUOX1-211ENST00000561166 4539 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TAS2R4-201ENST00000247881 2378 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ELP2-204ENST00000423854 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PSMB2-201ENST00000373237 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TRIT1-201ENST00000316891 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ZPR1-201ENST00000227322 6566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ZFP64-204ENST00000371515 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC087525.1-202ENST00000559821 1988 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 POTEC-201ENST00000358970 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 UBD-203ENST00000377050 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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LSAMPQ13449 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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LSAMPQ13449 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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LSAMPQ13449 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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LSAMPQ13449 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 C1S-201ENST00000328916 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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LSAMPQ13449 TMCO1-202ENST00000392129 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 UGT1A6-201ENST00000305139 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CES5A-202ENST00000319165 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LYSMD1-201ENST00000368908 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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LSAMPQ13449 GOLGA6D-201ENST00000434739 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 GEMIN8-202ENST00000380523 1682 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SEMA6A-205ENST00000503865 1678 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ARHGEF15-202ENST00000421050 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RIN2-201ENST00000255006 4505 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 FHAD1-202ENST00000358897 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ESR2-208ENST00000554572 3588 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LILRB4-202ENST00000391733 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 KBTBD12-203ENST00000405256 5268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SMARCAD1-204ENST00000457823 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 DLG2-208ENST00000404783 1831 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC100788.2-201ENST00000625199 2889 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 DEF8-201ENST00000268676 3725 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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