Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RPS6KA2-206ENST00000503859 4137 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TTC12-201ENST00000314756 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ASB15-202ENST00000434204 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC011199.1-201ENST00000625022 3362 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CCT6P1-201ENST00000434500 1544 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PABPC1L-205ENST00000372819 2100 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 UGT1A10-201ENST00000344644 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CAMK1G-202ENST00000361322 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LINC00661-204ENST00000549354 3340 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 HNF4A-209ENST00000619550 4763 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CYP11B1-201ENST00000292427 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AP003063.2-201ENST00000525984 2067 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SLC25A19-203ENST00000402418 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RD3-201ENST00000367002 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 GOLGA2-201ENST00000421699 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PLD2-205ENST00000572940 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DPF2-201ENST00000252268 2462 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ELF5-202ENST00000312319 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC009169.1-201ENST00000563784 1377 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LINC01686-201ENST00000566297 1376 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SEC23B-203ENST00000377465 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ZFP57-203ENST00000488757 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CASQ2-201ENST00000261448 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SRRM5-202ENST00000607544 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AP3B2-215ENST00000620652 3729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LGMNP1-201ENST00000441282 1300 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PASK-215ENST00000544142 4724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 GRHL3-204ENST00000361548 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TUT1-205ENST00000476907 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC090987.1-201ENST00000523502 2072 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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LSAMPQ13449 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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LSAMPQ13449 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CCDC85C-207ENST00000557769 3793 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TBC1D28-202ENST00000405044 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 NFYC-212ENST00000440226 1717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ABCC8-201ENST00000302539 4923 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ZWILCH-214ENST00000613446 3181 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LINC00910-202ENST00000586231 2890 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ANKRD46-206ENST00000520552 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ACSM4-201ENST00000399422 2142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CCDC36-203ENST00000438782 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PKD1L2-205ENST00000527937 4165 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ZNF627-204ENST00000588174 2755 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 UGT1A10-202ENST00000373445 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 GPATCH2-201ENST00000366934 3218 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MATN2-201ENST00000254898 4106 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ZNF141-201ENST00000240499 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AP005058.1-201ENST00000580193 2975 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LINC02453-201ENST00000501499 1825 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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