Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AD000671.1-201ENST00000591613 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC137834.2-201ENST00000617433 701 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CEP63-216ENST00000620544 1601 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 KRIT1-205ENST00000412043 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC046185.1-201ENST00000580553 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ETF1-202ENST00000499810 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 TRIM49B-201ENST00000332682 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 HOPX-205ENST00000420433 1543 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RNF167-207ENST00000572430 1511 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MINDY1-203ENST00000361936 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 VPS45-211ENST00000535106 2695 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 DCLK2-202ENST00000302176 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SPATA13-213ENST00000439928 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CA3-201ENST00000285381 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 MYL5-201ENST00000400159 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 FAM238A-201ENST00000412114 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC092329.4-208ENST00000640354 562 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ANXA13-202ENST00000419625 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CMTR2-202ENST00000434935 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ELP4-207ENST00000638347 1651 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CWC22-202ENST00000410053 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 DDX4-201ENST00000353507 2778 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC099489.3-201ENST00000572950 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LINC02211-203ENST00000642022 2816 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 VIL1-202ENST00000392114 1968 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LMO3Q8TAP4 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ACVR2A-202ENST00000404590 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 UGDH-AS1-201ENST00000504032 2787 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CCDC70-201ENST00000242819 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LHX9-202ENST00000367388 758 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 MBD3L2-201ENST00000381393 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 UQCC1-209ENST00000397556 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 HLA-U-204ENST00000418981 186 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LINC01524-202ENST00000454600 745 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 OR7E26P-201ENST00000502808 1006 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ZNHIT1P1-201ENST00000523947 444 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 C12orf80-202ENST00000551894 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 MYL4-208ENST00000572316 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LIN28B-AS1-204ENST00000636951 610 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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