Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPS6KL1Q9Y6S9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KL1Q9Y6S9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KL1Q9Y6S9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KL1Q9Y6S9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KL1Q9Y6S9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms