Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms