Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAI2Q9Y5P3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms