Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDP1Q9Y5B0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDP1Q9Y5B0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms