Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC42.08■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
DCAF1Q9Y4B6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
DCAF1Q9Y4B6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC41.99■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms