Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y4

PYGO1, Pygopus homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO1Q9Y3Y4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PYGO1Q9Y3Y4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PYGO1Q9Y3Y4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PYGO1Q9Y3Y4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PYGO1Q9Y3Y4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PYGO1Q9Y3Y4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PYGO1Q9Y3Y4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PYGO1Q9Y3Y4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PYGO1Q9Y3Y4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PYGO1Q9Y3Y4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PYGO1Q9Y3Y4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PYGO1Q9Y3Y4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PYGO1Q9Y3Y4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PYGO1Q9Y3Y4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms