Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF330Q9Y3S2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF330Q9Y3S2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms