Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN4Q9Y3Q4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms