Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms