Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms