Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A6Q9Y2P4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A6Q9Y2P4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC27A6Q9Y2P4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A6Q9Y2P4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1394 ms