Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFR3BQ9Y2G0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms