Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF13BQ9Y275 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms