Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HPSEQ9Y251 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HPSEQ9Y251 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPSEQ9Y251 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPSEQ9Y251 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms