Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms