Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHMP2BQ9UQN3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP2BQ9UQN3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1621.4 ms