Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVW-1Q9UQF0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms