Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms