Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TRAK1Q9UPV9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRAK1Q9UPV9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAK1Q9UPV9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms