Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms